247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00122 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  100 
 
 
303 aa  622  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.71 
 
 
304 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  45.72 
 
 
304 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  43.89 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  44.88 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.24 
 
 
309 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.1 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  39.8 
 
 
308 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5221  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  42.42 
 
 
300 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5638  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  42.42 
 
 
300 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0550  L-arabinonolactonase  41.92 
 
 
304 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621286  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0048  L-arabinonolactonase  41.89 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5473  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.79 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1625  senescence marker protein-30 family protein  40.78 
 
 
310 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4918  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.27 
 
 
299 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117058  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3209  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40 
 
 
301 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0193044 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1143  gluconolactonase  41.05 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1058  senescence marker protein-30 family protein  41.05 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0622  senescence marker protein-30 family protein  40.49 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0845  senescence marker protein-30 family protein  40.49 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1810  senescence marker protein-30 family protein  40.49 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  38.16 
 
 
291 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2356  senescence marker protein-30 family protein  40.7 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  34.4 
 
 
288 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.67 
 
 
302 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  33.45 
 
 
288 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  39.51 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.04 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.79 
 
 
300 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.04 
 
 
293 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.97 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51450  gluconolactonase  38.31 
 
 
284 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3831  senescence marker protein-30 (SMP-30)  37.28 
 
 
283 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  38.31 
 
 
296 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.93 
 
 
569 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.45 
 
 
300 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.71 
 
 
280 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.45 
 
 
300 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  36.3 
 
 
291 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.02 
 
 
330 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.15283  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33 
 
 
299 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  33.56 
 
 
289 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2591  gluconolactonase  37.22 
 
 
312 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000189317  normal  0.0284024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.68 
 
 
302 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.87 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.72 
 
 
289 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3876  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.85 
 
 
279 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  34.59 
 
 
294 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  33.67 
 
 
546 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  35.27 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3138  gluconolactonase  37.05 
 
 
279 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35 
 
 
304 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.3 
 
 
296 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  32.76 
 
 
295 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  34.15 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1240  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.79 
 
 
286 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.138164 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3297  response regulator receiver protein  33.9 
 
 
279 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.818338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  31.42 
 
 
309 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.42 
 
 
295 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000291446  hitchhiker  0.0000011261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  35.66 
 
 
289 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.29 
 
 
293 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  35.63 
 
 
303 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  35.66 
 
 
309 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.07 
 
 
292 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.42 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.22 
 
 
302 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2881  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.91 
 
 
302 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.204717  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  32.66 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.48 
 
 
292 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.14 
 
 
281 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2862  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.91 
 
 
302 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0267306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2812  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.91 
 
 
302 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.62 
 
 
312 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3491  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  35 
 
 
281 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2995  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.91 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0479  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.84 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 
293 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  32.76 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  32.14 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.76 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  34.63 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.53 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2883  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.55 
 
 
302 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.300083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0500  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.08 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.37 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0220  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.42 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.38 
 
 
301 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.38 
 
 
301 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  29.11 
 
 
300 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0543  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.09 
 
 
295 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5842  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.13 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.1 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  30.82 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  30.82 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  29.73 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.87 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  31.63 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  30.48 
 
 
300 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41751  predicted protein  32.86 
 
 
328 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000044531  hitchhiker  0.0048622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>