52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00114 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  100 
 
 		 262 aa  530  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.63 
 
 		 1094 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  52.27 
 
 		 747 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  50.29 
 
 		 741 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  43.86 
 
 		 825 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  46.2 
 
 		 842 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  50 
 
 		 759 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  46.15 
 
 		 811 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.64 
 
 		 784 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  42.22 
 
 		 816 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  38.71 
 
 		 768 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  39.47 
 
 		 864 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  39.31 
 
 		 868 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  36.08 
 
 		 781 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  40.57 
 
 		 822 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  39.38 
 
 		 841 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  35.58 
 
 		 833 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  39.23 
 
 		 825 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  34.54 
 
 		 758 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  43.97 
 
 		 757 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 		 824 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  32.86 
 
 		 1193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  35.26 
 
 		 1164 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  36.51 
 
 		 1139 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  34.39 
 
 		 778 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  34.73 
 
 		 760 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 		 786 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  31.46 
 
 		 802 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  32.8 
 
 		 790 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 		 835 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  35.62 
 
 		 991 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  38.55 
 
 		 742 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  48.89 
 
 		 940 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  44.59 
 
 		 809 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  30.05 
 
 		 1479 aa  95.1  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  38.19 
 
 		 856 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  34.36 
 
 		 803 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  31.4 
 
 		 831 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  38.1 
 
 		 762 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  28.49 
 
 		 788 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  27.32 
 
 		 796 aa  71.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  32.68 
 
 		 809 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.68 
 
 		 781 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  35.47 
 
 		 808 aa  62  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  32.4 
 
 		 773 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  40 
 
 		 646 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  26.15 
 
 		 943 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  30.34 
 
 		 809 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  30.96 
 
 		 837 aa  52.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  30 
 
 		 819 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  26.63 
 
 		 804 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  31.17 
 
 		 753 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>