51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00113 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  51.72 
 
 		 747 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.78 
 
 		 1094 aa  118  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  53.92 
 
 		 741 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  48.21 
 
 		 864 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  52.22 
 
 		 816 aa  103  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  52.04 
 
 		 1193 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  51.06 
 
 		 786 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  51.06 
 
 		 825 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  54.12 
 
 		 1164 aa  98.6  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  48.91 
 
 		 833 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  46.55 
 
 		 803 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  38.52 
 
 		 822 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  45.87 
 
 		 868 aa  97.1  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  50 
 
 		 802 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  42.37 
 
 		 841 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  49.44 
 
 		 811 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  44.64 
 
 		 768 aa  95.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  43.24 
 
 		 742 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  52.33 
 
 		 940 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  54.88 
 
 		 759 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  47.92 
 
 		 825 aa  93.6  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  40.32 
 
 		 842 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  46.24 
 
 		 790 aa  90.5  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49 
 
 		 784 aa  90.1  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  51.76 
 
 		 991 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  44.94 
 
 		 1479 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  51.09 
 
 		 781 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  40.37 
 
 		 760 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  40.57 
 
 		 778 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  52.38 
 
 		 757 aa  79.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  40.5 
 
 		 837 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  41.27 
 
 		 835 aa  78.2  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  43.33 
 
 		 1139 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  43.01 
 
 		 781 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  47.73 
 
 		 758 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  38.68 
 
 		 796 aa  75.9  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  39.09 
 
 		 808 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  41.94 
 
 		 762 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  47.19 
 
 		 773 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  39.13 
 
 		 856 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  38.74 
 
 		 646 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  40.66 
 
 		 819 aa  63.5  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  44.23 
 
 		 831 aa  62  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  36.61 
 
 		 788 aa  61.6  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  36.09 
 
 		 809 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  37 
 
 		 824 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  36.56 
 
 		 943 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  35.63 
 
 		 770 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  29.75 
 
 		 804 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  35.42 
 
 		 809 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>