More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00093 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  100 
 
 
417 aa  835    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  67.77 
 
 
406 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  66.58 
 
 
396 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  66.58 
 
 
396 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  66.32 
 
 
398 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  65.97 
 
 
398 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  67.7 
 
 
404 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  65.28 
 
 
398 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  68.03 
 
 
394 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  64.95 
 
 
393 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  64.78 
 
 
393 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  65.46 
 
 
393 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  65.46 
 
 
393 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  65.46 
 
 
393 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  65.46 
 
 
393 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  64.43 
 
 
393 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  64.69 
 
 
393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  64.69 
 
 
393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  64.43 
 
 
393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  64.43 
 
 
393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  64.43 
 
 
393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  64.43 
 
 
393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  64.43 
 
 
393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  64.43 
 
 
393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  58.07 
 
 
406 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  56.35 
 
 
407 aa  428  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  55.58 
 
 
450 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  54.68 
 
 
420 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  58.12 
 
 
402 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  57.64 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  57.99 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  57.64 
 
 
426 aa  415  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  57.71 
 
 
416 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  56.02 
 
 
398 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  56.67 
 
 
426 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  52.75 
 
 
406 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  50.77 
 
 
397 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  49.48 
 
 
394 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  42.71 
 
 
396 aa  364  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  46.17 
 
 
397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
395 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  45.64 
 
 
401 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  50.26 
 
 
383 aa  352  8.999999999999999e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
395 aa  349  4e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
395 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
395 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  42.86 
 
 
397 aa  342  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  42.93 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  45.55 
 
 
394 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  45.62 
 
 
388 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  46.79 
 
 
402 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  46.79 
 
 
402 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  38.62 
 
 
395 aa  325  7e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 
400 aa  322  7e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
395 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  47.04 
 
 
402 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  43.26 
 
 
410 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  43.26 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  43.83 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
340 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  42.63 
 
 
386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  39.8 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  41.41 
 
 
395 aa  305  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.14 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
398 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
399 aa  300  4e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
391 aa  300  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
408 aa  299  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  39.65 
 
 
437 aa  299  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
395 aa  299  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  42.6 
 
 
400 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  47.62 
 
 
400 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  42.6 
 
 
414 aa  298  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 
405 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  41.29 
 
 
404 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
396 aa  295  8e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  40.81 
 
 
399 aa  295  9e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
399 aa  291  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  40.2 
 
 
446 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  38.97 
 
 
439 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  39.49 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 
406 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
397 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 
404 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
438 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  39.75 
 
 
397 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
441 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
394 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
401 aa  281  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  40.7 
 
 
416 aa  281  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 
440 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>