21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00062 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  100 
 
 		 136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  51.13 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1838  hypothetical protein  45.11 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778721  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0256  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0226  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2739  PilT protein domain protein  37.88 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  32.58 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  34.59 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3514  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.522496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  29.32 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  27.69 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  27.27 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  27.1 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2924  nucleic acid-binding protein  27.27 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3219  putative nucleic acid-binding PilT-like protein  24.62 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3956  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.104147  normal  0.970496 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1712  hypothetical protein  27.61 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>