More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00028 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  100 
 
 
260 aa  523  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.31 
 
 
260 aa  418  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.43 
 
 
257 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.63 
 
 
262 aa  221  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  44.62 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.77 
 
 
265 aa  214  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  48.22 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  43.78 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.22 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.2 
 
 
265 aa  211  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  41.83 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.15 
 
 
265 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.04 
 
 
262 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.31 
 
 
263 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  46.27 
 
 
262 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  41.83 
 
 
255 aa  209  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.27 
 
 
262 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  41.43 
 
 
259 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  42.69 
 
 
262 aa  208  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.49 
 
 
262 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  44.09 
 
 
262 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  44.09 
 
 
262 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1182  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.01 
 
 
268 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.14884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.02 
 
 
263 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.55 
 
 
263 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.55 
 
 
263 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.23 
 
 
263 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.09 
 
 
262 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 
263 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  40.23 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.84 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.84 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.84 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.84 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.25 
 
 
263 aa  198  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.55 
 
 
284 aa  198  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  39.76 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.3 
 
 
264 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.32 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  42.91 
 
 
266 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.06 
 
 
263 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.16 
 
 
263 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.06 
 
 
259 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  34.66 
 
 
256 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  34.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  34.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  31.54 
 
 
258 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.27 
 
 
257 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.27 
 
 
257 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.09 
 
 
268 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.85 
 
 
270 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  35.38 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  33.07 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.6 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.11 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.71 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.15 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.91 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.8 
 
 
253 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  35.86 
 
 
323 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.78 
 
 
256 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 
301 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.15 
 
 
257 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  35.66 
 
 
265 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.84 
 
 
258 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.18 
 
 
273 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34 
 
 
257 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  35.66 
 
 
265 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  36.51 
 
 
263 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 
263 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.8 
 
 
255 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.51 
 
 
263 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  33.06 
 
 
254 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  33.84 
 
 
265 aa  142  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 
258 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  30.17 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.95 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.24 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.73 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.63 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 
270 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 
262 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
249 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  36.1 
 
 
262 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.95 
 
 
265 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.97 
 
 
433 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  38.25 
 
 
370 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 
253 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.36 
 
 
282 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>