More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00004 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  100 
 
 		 748 aa  1548    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  35.9 
 
 		 703 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  37.61 
 
 		 616 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  35.53 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  35.53 
 
 		 661 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.53 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  35.53 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  35.53 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 		 661 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  35.53 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  34.94 
 
 		 796 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.1 
 
 		 661 aa  361  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  32.16 
 
 		 741 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  32.55 
 
 		 741 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  33.66 
 
 		 613 aa  347  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  31.74 
 
 		 755 aa  346  7e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  31.8 
 
 		 741 aa  347  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  31.6 
 
 		 689 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  33.48 
 
 		 780 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  35.68 
 
 		 618 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  34.55 
 
 		 618 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  31.6 
 
 		 689 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  31.19 
 
 		 756 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 734 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  32.06 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  32.43 
 
 		 731 aa  337  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.77 
 
 		 748 aa  337  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  31.93 
 
 		 774 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  31.19 
 
 		 907 aa  336  9e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  34.75 
 
 		 646 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  32.51 
 
 		 777 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  34.32 
 
 		 643 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 788 aa  333  8e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  31.27 
 
 		 757 aa  332  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 		 734 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  32.25 
 
 		 731 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 734 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  35.79 
 
 		 688 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  32.33 
 
 		 754 aa  327  7e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  31.79 
 
 		 767 aa  326  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  31.11 
 
 		 792 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  34.66 
 
 		 763 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  31.9 
 
 		 794 aa  324  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  33.5 
 
 		 693 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  31.54 
 
 		 767 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  35.38 
 
 		 808 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  30.57 
 
 		 771 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  30.82 
 
 		 730 aa  318  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  33.77 
 
 		 614 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  37.98 
 
 		 841 aa  316  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  33.5 
 
 		 680 aa  316  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  33.5 
 
 		 778 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  34.88 
 
 		 572 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  30.99 
 
 		 741 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  32.23 
 
 		 785 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  37.94 
 
 		 841 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  37.94 
 
 		 841 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  35.44 
 
 		 782 aa  314  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  35.44 
 
 		 782 aa  314  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  31.86 
 
 		 683 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  30.85 
 
 		 741 aa  313  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  31.21 
 
 		 754 aa  313  9e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 702 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  33.12 
 
 		 680 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  34.41 
 
 		 684 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 645 aa  313  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  33.82 
 
 		 794 aa  312  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  37.74 
 
 		 838 aa  313  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  33.45 
 
 		 730 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  35.68 
 
 		 687 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  34.33 
 
 		 680 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  31.02 
 
 		 724 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  33.27 
 
 		 729 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  32.81 
 
 		 783 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  31.91 
 
 		 683 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  34.94 
 
 		 680 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  33.27 
 
 		 729 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  35.12 
 
 		 875 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  34.17 
 
 		 680 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  34.96 
 
 		 871 aa  306  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  32.94 
 
 		 741 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  32.41 
 
 		 1003 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  30.09 
 
 		 792 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  30.85 
 
 		 901 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  33.92 
 
 		 869 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  31.08 
 
 		 769 aa  303  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  32.46 
 
 		 618 aa  302  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  34.46 
 
 		 694 aa  301  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  31.52 
 
 		 872 aa  299  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  33.55 
 
 		 619 aa  299  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  33.09 
 
 		 743 aa  297  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  34.78 
 
 		 790 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  32.19 
 
 		 706 aa  296  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  30.6 
 
 		 692 aa  296  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  30.83 
 
 		 692 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  31.22 
 
 		 896 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>