More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5557 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5557  adenylylsulfate kinase  100 
 
 
222 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0637  adenylylsulfate kinase  57.29 
 
 
211 aa  219  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3519  adenylate sulfate kinase protein  55.56 
 
 
209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24694  adenylylsulfate kinase  53.44 
 
 
201 aa  214  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02714  adenylylsulfate kinase  52.38 
 
 
198 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0820  adenylyl-sulfate kinase  52.91 
 
 
209 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0666  adenylylsulfate kinase  54.01 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3221  adenylylsulfate kinase  52.58 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0712  adenylyl-sulfate kinase  51.05 
 
 
201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000090997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0411  adenylylsulfate kinase  50.26 
 
 
201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2622  adenylylsulfate kinase  52.38 
 
 
199 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0591419  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2185  adenylylsulfate kinase  50 
 
 
199 aa  211  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2345  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  54.26 
 
 
638 aa  211  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0833  adenylylsulfate kinase  54.5 
 
 
204 aa  211  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  55.74 
 
 
647 aa  210  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0834  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.49 
 
 
640 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0864  adenylylsulfate kinase  52.28 
 
 
207 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  55.79 
 
 
614 aa  208  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0967  adenylylsulfate kinase  50 
 
 
213 aa  208  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3302  adenylylsulfate kinase  50 
 
 
213 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  51.76 
 
 
638 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3434  adenylylsulfate kinase  51.05 
 
 
234 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.658603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0423  adenylylsulfate kinase  51.58 
 
 
210 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2332  adenylyl-sulfate kinase  55.8 
 
 
219 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0456568  normal  0.0456553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5496  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  55.68 
 
 
640 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16180  Adenylylsulfate kinase  59.41 
 
 
197 aa  205  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.732852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  58.96 
 
 
604 aa  204  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3123  adenylylsulfate kinase  51.58 
 
 
201 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3243  adenylylsulfate kinase  51.58 
 
 
201 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3058  adenylylsulfate kinase  51.58 
 
 
201 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3139  adenylylsulfate kinase  51.58 
 
 
201 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.476768  normal  0.15294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3084  adenylylsulfate kinase  51.58 
 
 
201 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.65 
 
 
651 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2985  adenylyl-sulfate kinase  49 
 
 
223 aa  204  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.879711  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0299  adenylylsulfate kinase  50.8 
 
 
225 aa  204  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9629  sulfate adenylate transferase subunit 1  52.58 
 
 
636 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1500  adenylylsulfate kinase  54.89 
 
 
198 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2888  adenylylsulfate kinase  50.8 
 
 
198 aa  203  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1425  adenylyl-sulfate kinase  50.81 
 
 
209 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.403059  normal  0.0845056 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2420  adenylylsulfate kinase  46.8 
 
 
214 aa  202  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2350  adenylyl-sulfate kinase  53.72 
 
 
199 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3359  adenylylsulfate kinase  48.48 
 
 
205 aa  202  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0800  adenylyl-sulfate kinase  49.23 
 
 
210 aa  202  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000729878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2957  adenylyl-sulfate kinase  49.75 
 
 
228 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0903  adenylylsulfate kinase  52.13 
 
 
205 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4087  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
212 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0957  adenylylsulfate kinase  51.06 
 
 
205 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0931  adenylylsulfate kinase  51.06 
 
 
205 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1363  adenylyl-sulfate kinase  52.6 
 
 
204 aa  201  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2145  adenylylsulfate kinase  50.79 
 
 
209 aa  201  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0962  adenylylsulfate kinase  54.97 
 
 
205 aa  201  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0201  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.89 
 
 
644 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2290  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  54.7 
 
 
641 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3405  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
205 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2135  adenylylsulfate kinase  50.26 
 
 
215 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0965  adenylylsulfate kinase  51.06 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3040  adenylylsulfate kinase  51.06 
 
 
205 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  48.15 
 
 
203 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02401  adenylylsulfate kinase  50 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02600  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0938  Adenylyl-sulfate kinase  50.53 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02565  hypothetical protein  50.53 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3516  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
205 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1689  adenylyl-sulfate kinase  47.74 
 
 
222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664653  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4002  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2888  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3051  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.256539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2876  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.878793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3124  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
201 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01831  adenylylsulfate kinase  48 
 
 
217 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.573546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0387  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  48 
 
 
619 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0396  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  48 
 
 
619 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668452  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0375  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  48 
 
 
619 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435522  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27091  adenylylsulfate kinase  49.47 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  50.53 
 
 
644 aa  198  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1533  adenylylsulfate kinase  49.47 
 
 
212 aa  198  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4560  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  52.78 
 
 
633 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0962  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
201 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.510912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001704  adenylylsulfate kinase  48.24 
 
 
205 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1650  adenylylsulfate kinase  49.75 
 
 
198 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3069  adenylylsulfate kinase  51.06 
 
 
205 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6191  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  53.33 
 
 
633 aa  197  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0866  adenylylsulfate kinase  51.06 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  50 
 
 
633 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2338  adenylyl-sulfate kinase  51.03 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00543558  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2204  adenylylsulfate kinase  48.94 
 
 
203 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1749  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  52.15 
 
 
642 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1028  adenylylsulfate kinase  51.6 
 
 
283 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2763  adenylylsulfate kinase  54.49 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4775  Adenylyl-sulfate kinase  54.89 
 
 
220 aa  194  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2056  adenylylsulfate kinase  49.48 
 
 
255 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  51.41 
 
 
631 aa  194  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0939  adenylylsulfate kinase  47.62 
 
 
208 aa  194  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3723  adenylylsulfate kinase  50.53 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3831  adenylyl-sulfate kinase  48.45 
 
 
208 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00769  adenylylsulfate kinase  49.21 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2619  adenylylsulfate kinase  51.06 
 
 
236 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0450  adenylylsulfate kinase  51.91 
 
 
260 aa  194  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  51.08 
 
 
640 aa  194  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5747  adenylylsulfate kinase  50.52 
 
 
214 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.149509  normal  0.606643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>