59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5458 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  328  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  83.02 
 
 		 159 aa  270  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  59.21 
 
 		 155 aa  180  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2108  hypothetical protein  60 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3188  hypothetical protein  46.41 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4972  hypothetical protein  46.41 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4291  hypothetical protein  46.41 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  28.15 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  27.48 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  27.48 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  26.72 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  26.72 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  26.72 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  27.48 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  27.59 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  25.66 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  31.46 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  32.08 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.03 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  23.08 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  23.66 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  22.31 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  22.31 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  31.19 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  31.19 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  26.47 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  24.29 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  24.76 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  23.02 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  31.43 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  25.93 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  25 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  25 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  22.22 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  29.46 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  29.55 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  22.63 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  31.73 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  26.49 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  22.45 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  26.26 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  28.57 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  30.48 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  32.48 
 
 		 1621 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  25 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  26.96 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  23.81 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  31.62 
 
 		 1621 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  28.68 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  26.36 
 
 		 177 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  24.73 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  30.77 
 
 		 1621 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  30.77 
 
 		 1663 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.264525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>