More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5292 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5292  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  100 
 
 
221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4850  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  94.12 
 
 
221 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5153  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  78.18 
 
 
221 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479206  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5206  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  78.64 
 
 
221 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640418  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5385  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  81 
 
 
221 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5060  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  77.73 
 
 
221 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0312  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  78.18 
 
 
221 aa  361  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04150  hypothetical protein  73.18 
 
 
221 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48300  Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  74.55 
 
 
233 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4230  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  73.18 
 
 
232 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0411  hypothetical protein  72.27 
 
 
221 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2815  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.33 
 
 
220 aa  228  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2118  hypothetical protein  46.33 
 
 
218 aa  214  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0891763  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2007  hypothetical protein  46.33 
 
 
218 aa  214  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0101882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2395  hypothetical protein  46.33 
 
 
218 aa  214  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0911799  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1505  hypothetical protein  45.66 
 
 
219 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2011  hypothetical protein  45.66 
 
 
219 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.517468  normal  0.203097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1954  hypothetical protein  45.66 
 
 
219 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0707644  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1951  hypothetical protein  45.66 
 
 
219 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2468  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  45.21 
 
 
219 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2238  hypothetical protein  45.41 
 
 
218 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000304661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01155  predicted isomerase/hydrolase  45.21 
 
 
219 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01165  hypothetical protein  45.21 
 
 
219 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1324  hypothetical protein  45.21 
 
 
219 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1280  hypothetical protein  45.21 
 
 
219 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000019251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1335  hypothetical protein  45.21 
 
 
219 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00641682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1666  hypothetical protein  45.21 
 
 
219 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000638137  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2445  hypothetical protein  45.21 
 
 
219 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1942  hypothetical protein  45.41 
 
 
218 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1321  hypothetical protein  45.21 
 
 
219 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1999  hypothetical protein  45.41 
 
 
218 aa  204  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00012789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1969  hypothetical protein  45.21 
 
 
219 aa  204  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000105527  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2753  hypothetical protein  44.5 
 
 
218 aa  203  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000267242  hitchhiker  0.000114559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0330  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.76 
 
 
238 aa  203  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2800  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.37 
 
 
219 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3666  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  47.78 
 
 
218 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2369  hypothetical protein  44.29 
 
 
219 aa  201  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000473957  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2004  hypothetical protein  44.04 
 
 
218 aa  201  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.394178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2937  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.29 
 
 
218 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000218618 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0299  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.76 
 
 
238 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01142  putative fumarylacetoacetate hydrolase family protein  44.8 
 
 
222 aa  198  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  47.34 
 
 
218 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0650  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.08 
 
 
218 aa  190  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0663  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  45.59 
 
 
218 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8085999999999997e-26 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0543  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.06 
 
 
225 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0262694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3591  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  44.06 
 
 
218 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000122928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0603  FAA hydrolase family protein  43.43 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000290593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2939  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.1 
 
 
203 aa  174  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.494423  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.21 
 
 
212 aa  169  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202477  normal  0.468073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4986  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.79 
 
 
203 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0882  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.08 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308706 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13578  putative hydrolase  42.33 
 
 
204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1536  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.55 
 
 
203 aa  164  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1114  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  41 
 
 
219 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3697  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.71 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.6 
 
 
205 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1185  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  41.24 
 
 
219 aa  157  8e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2909  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  42.03 
 
 
230 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.332948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0677  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.04 
 
 
234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1891  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  40.96 
 
 
203 aa  154  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3596  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.72 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111353  normal  0.0779412 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0740  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.62 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0190652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1873  hypothetical protein  38.97 
 
 
235 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2676  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.81 
 
 
234 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2816  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.71 
 
 
231 aa  151  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.721008  hitchhiker  0.0000024017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5203  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.52 
 
 
264 aa  151  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5863  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.57 
 
 
253 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80437  fumarylacetoacetate hydralase  40.29 
 
 
231 aa  150  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0346038  normal  0.482803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3776  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  40.72 
 
 
256 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0147  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.67 
 
 
232 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2087  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.61 
 
 
224 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1535  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.45 
 
 
203 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0341155  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0423  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.29 
 
 
256 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661948  normal  0.403519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1093  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.86 
 
 
202 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4441  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.2 
 
 
232 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4220  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.59 
 
 
232 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4146  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.59 
 
 
232 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160093  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01210  mitochondrion protein, putative  42.05 
 
 
228 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.490082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2432  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  40.85 
 
 
233 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0332  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  40 
 
 
233 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5803  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.14 
 
 
232 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2323  FAA-hydrolase-family protein  40.38 
 
 
233 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2416  FAA-hydrolase-family protein  40.38 
 
 
233 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2412  FAA-hydrolase family protein  40.38 
 
 
233 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2524  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  40.38 
 
 
233 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2367  FAA-hydrolase family protein  40.38 
 
 
233 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.169326  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0279  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40 
 
 
266 aa  148  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.559934  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3269  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  40.85 
 
 
233 aa  148  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.236838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2078  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.26 
 
 
231 aa  148  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1086  putative isomerase-decarboxylase  38.57 
 
 
232 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32670  hypothetical protein  37.62 
 
 
232 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000391327  hitchhiker  0.0000208849 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0383  hypothetical protein  40.48 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.588829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1888  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.1 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2018  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.28 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2264  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  40.85 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3373  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.71 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112296  normal  0.346453 
 
 
-
 
NC_004310  BR0063  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.32 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1677  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.78 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.800345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10990  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.4 
 
 
261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0062  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  39.32 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>