More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5266 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  93.56 
 
 
262 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  86.36 
 
 
261 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  82.2 
 
 
257 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  82.58 
 
 
257 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  81.82 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  81.82 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  80.61 
 
 
262 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  75.46 
 
 
269 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  75.84 
 
 
269 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  73.11 
 
 
257 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  59.02 
 
 
253 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  59.02 
 
 
253 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  59.02 
 
 
253 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 
252 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  57.77 
 
 
252 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  57.77 
 
 
252 aa  291  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  58.92 
 
 
251 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  58.92 
 
 
251 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  58.92 
 
 
251 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  58.92 
 
 
251 aa  290  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  58.92 
 
 
251 aa  290  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  58.92 
 
 
251 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  58.92 
 
 
251 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  58.92 
 
 
252 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  58.75 
 
 
251 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  58.92 
 
 
251 aa  290  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  58.92 
 
 
251 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  58.51 
 
 
251 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  58.51 
 
 
251 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  58.51 
 
 
268 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  58.51 
 
 
251 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  58.51 
 
 
251 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  57.44 
 
 
252 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  54.34 
 
 
258 aa  284  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  58.94 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  54.13 
 
 
293 aa  265  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 
298 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 
298 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  55.08 
 
 
304 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  53.39 
 
 
303 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  51.25 
 
 
258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  55.75 
 
 
262 aa  258  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  55.31 
 
 
262 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  52.3 
 
 
276 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  54.55 
 
 
256 aa  255  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  55.9 
 
 
260 aa  254  9e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  49.43 
 
 
301 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  52.77 
 
 
261 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  56.68 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  53.74 
 
 
283 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  51.98 
 
 
244 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  51.5 
 
 
316 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  51.77 
 
 
243 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  51.77 
 
 
243 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  49.33 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  47.03 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  48 
 
 
264 aa  222  6e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  46.26 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  48.46 
 
 
247 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  44.32 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  45.06 
 
 
256 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  51.18 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
242 aa  181  8.000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  42.6 
 
 
275 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  37.33 
 
 
217 aa  179  4.999999999999999e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  39.75 
 
 
248 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  39.74 
 
 
243 aa  176  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.39 
 
 
231 aa  161  8.000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  36.17 
 
 
240 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  36.17 
 
 
240 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  40.09 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  35.93 
 
 
271 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  38.43 
 
 
269 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  39.41 
 
 
250 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  34.84 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  36.48 
 
 
248 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  36.89 
 
 
257 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  37.78 
 
 
308 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  38.53 
 
 
250 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.11 
 
 
240 aa  141  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  38.12 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  34.4 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  31.8 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 
257 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
230 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  30.47 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  36.13 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  31.62 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  36.57 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  35.77 
 
 
254 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  34.42 
 
 
259 aa  135  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  31.62 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  33.72 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  35.14 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  32.17 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  31.08 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  31.46 
 
 
256 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  34.94 
 
 
243 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>