229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5200 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  100 
 
 		 986 aa  1974    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  93.2 
 
 		 995 aa  1831    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  48.77 
 
 		 1053 aa  790    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43 
 
 		 1011 aa  733    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.24 
 
 		 1285 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  38.44 
 
 		 1550 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.6 
 
 		 1029 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  48.28 
 
 		 661 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  46.26 
 
 		 657 aa  380  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  38.75 
 
 		 1119 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  41.18 
 
 		 2346 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  39.88 
 
 		 1508 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  41.02 
 
 		 2365 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  42.4 
 
 		 634 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  47.05 
 
 		 652 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.55 
 
 		 634 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  47.05 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.21 
 
 		 1848 aa  359  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  44.09 
 
 		 683 aa  358  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  46.93 
 
 		 653 aa  357  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  40.76 
 
 		 2396 aa  354  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  47.17 
 
 		 653 aa  353  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  41.32 
 
 		 2371 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  47.17 
 
 		 653 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  41.16 
 
 		 2366 aa  350  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  36.22 
 
 		 983 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  42.56 
 
 		 641 aa  345  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  38.18 
 
 		 3506 aa  343  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 		 1004 aa  340  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  37.09 
 
 		 1001 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  34.17 
 
 		 1055 aa  335  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  35.22 
 
 		 1038 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  36.52 
 
 		 1001 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  36.63 
 
 		 2003 aa  329  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  33.95 
 
 		 1033 aa  329  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  33.42 
 
 		 1028 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  34.27 
 
 		 991 aa  313  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.34 
 
 		 1227 aa  307  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  33.99 
 
 		 995 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  35.18 
 
 		 990 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.48 
 
 		 972 aa  295  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.64 
 
 		 919 aa  293  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  32.47 
 
 		 650 aa  293  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  31.03 
 
 		 1177 aa  293  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  35.19 
 
 		 1782 aa  291  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  34.45 
 
 		 1129 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  34.45 
 
 		 1131 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  34.29 
 
 		 1129 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  34.29 
 
 		 1131 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  34.29 
 
 		 1131 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  34.29 
 
 		 1131 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  35.27 
 
 		 1130 aa  287  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.44 
 
 		 1125 aa  287  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  31.88 
 
 		 1006 aa  280  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  34.14 
 
 		 1131 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  35.57 
 
 		 1164 aa  270  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  35.38 
 
 		 985 aa  265  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  30.98 
 
 		 1519 aa  265  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  36.94 
 
 		 1062 aa  261  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  38.42 
 
 		 1056 aa  256  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  34.18 
 
 		 3954 aa  254  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  32.99 
 
 		 4238 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 677 aa  246  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  32.84 
 
 		 4238 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  32.84 
 
 		 3822 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1881 aa  240  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  48.11 
 
 		 348 aa  234  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  32.25 
 
 		 994 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  31.94 
 
 		 1333 aa  213  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  34.46 
 
 		 1016 aa  199  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  31.02 
 
 		 1152 aa  195  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  30.96 
 
 		 2711 aa  193  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  32.29 
 
 		 980 aa  184  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  35.03 
 
 		 1011 aa  175  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  29.11 
 
 		 816 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  34.26 
 
 		 488 aa  159  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.8 
 
 		 1081 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.99 
 
 		 926 aa  134  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  32.82 
 
 		 311 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.45 
 
 		 910 aa  129  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.2 
 
 		 915 aa  127  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.56 
 
 		 1532 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  27.26 
 
 		 1180 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.25 
 
 		 425 aa  124  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 		 465 aa  124  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.44 
 
 		 1769 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.2 
 
 		 1066 aa  122  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35 
 
 		 431 aa  119  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.58 
 
 		 447 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  26.69 
 
 		 407 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  31.08 
 
 		 423 aa  112  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.86 
 
 		 906 aa  112  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  32.16 
 
 		 423 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.55 
 
 		 913 aa  110  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  32.16 
 
 		 423 aa  110  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.51 
 
 		 1489 aa  109  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  24.57 
 
 		 954 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  27.51 
 
 		 1459 aa  104  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.02 
 
 		 510 aa  104  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  25.18 
 
 		 974 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>