More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5190 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  90.82 
 
 		 208 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  78.26 
 
 		 209 aa  345  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  73.43 
 
 		 208 aa  324  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  71.22 
 
 		 218 aa  310  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  72.59 
 
 		 207 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  70.79 
 
 		 208 aa  299  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  65.22 
 
 		 213 aa  294  8e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  65.84 
 
 		 211 aa  287  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  66.18 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  64.73 
 
 		 208 aa  282  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  59.39 
 
 		 210 aa  265  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  54.23 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  36 
 
 		 1287 aa  91.3  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  34.15 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  31.54 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  30.92 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  30.59 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  32.52 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  29.79 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  32.52 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  31.01 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  36.22 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  30.89 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  33.59 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  33.09 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  28.93 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.38 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  36.5 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  31.07 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  31.07 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  31.07 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  31.07 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  31.07 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  29.19 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  30.51 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  31.29 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  29.93 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  31.69 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  30.07 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  29.76 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  28.86 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.29 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  24.84 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 2490 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1564  conserved hypothetical protein, possible methyltransferase  27.68 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 277 aa  54.7  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  34.48 
 
 		 303 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  29.59 
 
 		 440 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>