More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5152 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  80 
 
 		 540 aa  853    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  100 
 
 		 539 aa  1091    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  99.07 
 
 		 539 aa  1084    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  79.26 
 
 		 540 aa  844    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  84.97 
 
 		 534 aa  908    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  75.19 
 
 		 537 aa  805    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  79.96 
 
 		 539 aa  827    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  76.81 
 
 		 527 aa  779    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  76.34 
 
 		 533 aa  829    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  76.16 
 
 		 533 aa  828    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  62.53 
 
 		 547 aa  595  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  62.36 
 
 		 553 aa  569  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.96 
 
 		 547 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.1 
 
 		 558 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.14 
 
 		 534 aa  568  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  57.08 
 
 		 549 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  57.3 
 
 		 549 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  61.23 
 
 		 561 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  60.81 
 
 		 540 aa  555  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  60.22 
 
 		 553 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  59.83 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.97 
 
 		 556 aa  545  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.19 
 
 		 546 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.62 
 
 		 546 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.62 
 
 		 546 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.62 
 
 		 546 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.41 
 
 		 543 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.62 
 
 		 546 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.62 
 
 		 546 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.66 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.66 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  53.66 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3639  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.86 
 
 		 543 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.66 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.66 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0273  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.86 
 
 		 543 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.66 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.66 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.66 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.12 
 
 		 544 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3943  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.86 
 
 		 543 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.27 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.93 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.11 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.47 
 
 		 544 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.54 
 
 		 546 aa  535  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.93 
 
 		 546 aa  535  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  58.3 
 
 		 542 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.15 
 
 		 545 aa  529  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  57.02 
 
 		 544 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.87 
 
 		 546 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.26 
 
 		 544 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.17 
 
 		 543 aa  528  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.08 
 
 		 545 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  52.25 
 
 		 541 aa  517  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.91 
 
 		 525 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.14 
 
 		 541 aa  513  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.17 
 
 		 509 aa  512  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0296  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  54.81 
 
 		 522 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877142  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.65 
 
 		 525 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.65 
 
 		 525 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.61 
 
 		 525 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.95 
 
 		 549 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.22 
 
 		 517 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  51.79 
 
 		 525 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.02 
 
 		 521 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  51.64 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  52.32 
 
 		 549 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.28 
 
 		 544 aa  500  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.02 
 
 		 521 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.26 
 
 		 506 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.01 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.28 
 
 		 521 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.26 
 
 		 549 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.32 
 
 		 549 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.05 
 
 		 549 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4201  ubiquinone biosynthesis protein AarF  51.27 
 
 		 549 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.07 
 
 		 527 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.74 
 
 		 522 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.11 
 
 		 525 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.27 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.18 
 
 		 525 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.67 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.18 
 
 		 525 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.63 
 
 		 549 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.13 
 
 		 522 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.27 
 
 		 549 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.27 
 
 		 549 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.69 
 
 		 549 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.05 
 
 		 549 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.27 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.48 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.88 
 
 		 525 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.21 
 
 		 522 aa  485  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.88 
 
 		 525 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.88 
 
 		 525 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.88 
 
 		 525 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.8 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.88 
 
 		 525 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.88 
 
 		 525 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>