147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5135 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  78.46 
 
 		 267 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  66.12 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  59.92 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  58.78 
 
 		 273 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  58.37 
 
 		 273 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  56.1 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  55.69 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  53.78 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  54.07 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  34.01 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  37.39 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  38.76 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  28.92 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  30.36 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  29.67 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  26.77 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  36.17 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  29.65 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  31.66 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  25.12 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  41.06 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  27.19 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  34.29 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  35.04 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  31.78 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  34.25 
 
 		 180 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  34.31 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  32.11 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  32.24 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  28.25 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  35.61 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.59 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  33.08 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  33.08 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  32.41 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  29.94 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  28.7 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.58 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  35.25 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  32.82 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  32.62 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  29.75 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  30.77 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  29.41 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  29.13 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.11 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  32.38 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.54 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  26.74 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.99 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  26.94 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  29.23 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.41 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  31.51 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  31.94 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.88 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.45 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  30.5 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  34.65 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  31.3 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  33.33 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.27 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.31 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  30.77 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  34.15 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  32.85 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  25.69 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  25.62 
 
 		 171 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  26.87 
 
 		 153 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  32.81 
 
 		 408 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  28.15 
 
 		 156 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  26.12 
 
 		 153 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  30.15 
 
 		 214 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  32.74 
 
 		 382 aa  52  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30.22 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.36 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  25.52 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  29.25 
 
 		 374 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  31.48 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  34.88 
 
 		 136 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  26.54 
 
 		 187 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  28.94 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  28.93 
 
 		 346 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  38.03 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  32.71 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  23.61 
 
 		 183 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  33.33 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.15 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.15 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  23.29 
 
 		 183 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  25.31 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  37.93 
 
 		 143 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.47 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  34.78 
 
 		 124 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>