More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5105 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  88.28 
 
 		 244 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  80.85 
 
 		 241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  65.8 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  65.8 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  66.09 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  65.65 
 
 		 239 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  65.67 
 
 		 246 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  62.45 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  63.68 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  62.13 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.49 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.5 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  31.61 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  27.91 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  31.87 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  43.88 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.85 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  28 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.77 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.67 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.32 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 324 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.29 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  27.84 
 
 		 351 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  36.54 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  35.59 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  31.36 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1986  methyltransferase type 11  36 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.66 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  35.59 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.66 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 1106 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0899  methyltransferase  32.35 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.11 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  28.3 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  34.01 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>