58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5089 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  314  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  75.97 
 
 
131 aa  211  2e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  46.67 
 
 
89 aa  61.2  4e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  43.42 
 
 
83 aa  59.3  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  39.47 
 
 
83 aa  57.8  6e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  39.74 
 
 
466 aa  57.4  8e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  39.74 
 
 
466 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  55.8  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  40.79 
 
 
83 aa  55.8  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  41.89 
 
 
101 aa  55.5  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 
88 aa  55.5  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  41.89 
 
 
88 aa  55.5  3e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  45.33 
 
 
86 aa  54.7  4e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 
87 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  38.16 
 
 
83 aa  54.3  6e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  38.16 
 
 
83 aa  54.3  6e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  37.78 
 
 
94 aa  53.1  1e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  39.51 
 
 
93 aa  52.4  2e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  37.93 
 
 
87 aa  52.4  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  36.56 
 
 
95 aa  50.4  7e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  36.36 
 
 
83 aa  50.1  1e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  38.36 
 
 
87 aa  50.1  1e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  35.63 
 
 
133 aa  49.7  1e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  40.23 
 
 
102 aa  49.7  1e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  35.9 
 
 
92 aa  50.1  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  35.8 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  39.33 
 
 
85 aa  48.1  4e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  48.1  5e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  36.99 
 
 
92 aa  47.4  7e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  39.44 
 
 
86 aa  47  9e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  39.02 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  33.72 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  37.23 
 
 
137 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  35.14 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0016  PAAR  38.89 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  35.06 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  40.28 
 
 
465 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  37.97 
 
 
90 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  38.2 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  4.29039e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  39.34 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  36.99 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  37.18 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  36.11 
 
 
453 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  37.21 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  42.03 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  32.26 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  48.84 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  35.48 
 
 
176 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4083  PAAR  31.17 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  29.33 
 
 
191 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  35.06 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  42.55 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  35.06 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  34.74 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  36.07 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  35.48 
 
 
175 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  30.67 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.040505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>