57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5083 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0446  malonate decarboxylase gamma subunit  92.48 
 
 		 266 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10320  Malonate decarboxylase gamma subunit  71.1 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02590  malonate decarboxylase gamma subunit  71.48 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0619996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5298  malonate decarboxylase gamma subunit  77.27 
 
 		 261 aa  374  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47948  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0296  malonate decarboxylase subunit gamma  71.48 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2442  malonate decarboxylase, gamma subunit  66.03 
 
 		 263 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2879  malonate decarboxylase, gamma subunit  65.27 
 
 		 263 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2608  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.7 
 
 		 266 aa  304  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1243  malonate decarboxylase, gamma subunit  61.22 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0950  malonate decarboxylase gamma subunit  62.21 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3775  malonate decarboxylase gamma subunit  58.11 
 
 		 266 aa  288  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4929  malonate decarboxylase gamma subunit  57.25 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3656  malonate decarboxylase gamma subunit  56.27 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3867  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.85 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4943  malonate decarboxylase, gamma subunit  59.85 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0583911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  50.75 
 
 		 272 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.178528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4817  malonate decarboxylase, gamma subunit  50.92 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0587607  normal  0.0256459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4589  malonate decarboxylase gamma subunit  47.19 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1848  putative malonate decarboxylase gamma subunit  50.38 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415688  normal  0.0801286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1060  malonate decarboxylase gamma subunit  37.06 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0857455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3295  malonate decarboxylase gamma subunit  32.29 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1325  hypothetical protein  33.51 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2047  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.8 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1162  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.1 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  34.65 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0791  malonate decarboxylase gamma subunit  32.97 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1150  malonate decarboxylase gamma subunit  32.39 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3189  malonate decarboxylase, gamma subunit  36.81 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0049  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.16 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.0466048 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1244  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.92 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58858  normal  0.076268 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5371  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.68 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0791  malonate decarboxylase gamma subunit  30.92 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6854  malonate decarboxylase, gamma subunit  32.45 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1272  malonate decarboxylase gamma subunit  30.92 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00955431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4415  malonate decarboxylase gamma subunit  31.69 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0170  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.49 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.212333  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2495  hypothetical protein  23.08 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3154  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.61 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2892  malonate decarboxylase gamma subunit  31.55 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0027  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.65 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4017  malonate decarboxylase gamma subunit  33.33 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0076  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.19 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0028  malonate decarboxylase, gamma subunit  29.63 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1078  malonate decarboxylase, gamma subunit  29.05 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1143  putative malonate decarboxylase gamma subunit  28.57 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216529  normal  0.546838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4289  malonate decarboxylase gamma subunit  31.97 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1846  malonate decarboxylase gamma subunit  32.48 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1455  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.54 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0490368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0542  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.54 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.960263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1485  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.54 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0611  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.54 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1259  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.54 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1585  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.54 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.911971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3034  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.54 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1765  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.77 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2800  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.71 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>