More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4952 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  100 
 
 		 341 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  90.54 
 
 		 349 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  75.96 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  71.14 
 
 		 346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  74.26 
 
 		 339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  71.23 
 
 		 346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  72.78 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  65.91 
 
 		 329 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  70.93 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  64.74 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  59.64 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  47.46 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  46.24 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  48.43 
 
 		 316 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  49.65 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  41.64 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  46.88 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  44.33 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  45.07 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  42.95 
 
 		 320 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  43.79 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  43.26 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  45.64 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 345 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  44.88 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  40.41 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  40.71 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  40.71 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  40.71 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  41.02 
 
 		 339 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  42.35 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  38.89 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  42.36 
 
 		 451 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  42.86 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  42.86 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  40.72 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  39.94 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  47.06 
 
 		 315 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  47.06 
 
 		 315 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  41.84 
 
 		 338 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  38.97 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  42.35 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  47.65 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  41.78 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  41.78 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  41.78 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  42.12 
 
 		 338 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  41.32 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  41.32 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  41.32 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  41.32 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  41.32 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4157  OmpA/MotB domain protein  43.49 
 
 		 315 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  42.01 
 
 		 358 aa  222  9e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  45.49 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.81 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  39.86 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  38.78 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  38.78 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  38.78 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  38.78 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  38.78 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  38.78 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  38.78 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  40.5 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  38.89 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  40.14 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  42.25 
 
 		 312 aa  208  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  41.46 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  43.37 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1854  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00497305  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  41.9 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2612  OmpA/MotB domain protein  43.55 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  39.39 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  37.54 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  42.68 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.36 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2025  OmpA/MotB  41.02 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0231038  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  38.93 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  39.51 
 
 		 298 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  37.81 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  38.7 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3946  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  36 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  36.12 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.06 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  37.45 
 
 		 307 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  36.36 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1997  OmpA/MotB domain protein  35.27 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3437  flagellar motor protein  42.45 
 
 		 245 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1682  putative chemotaxis MotB protein  42.45 
 
 		 245 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  35.99 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  36.21 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3579  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  36.01 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>