More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4929 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  89.87 
 
 		 465 aa  865    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  100 
 
 		 464 aa  947    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  98.92 
 
 		 464 aa  940    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  86.21 
 
 		 464 aa  843    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  68.35 
 
 		 458 aa  648    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  95.69 
 
 		 465 aa  912    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  71.24 
 
 		 462 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  87.04 
 
 		 463 aa  847    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  89.87 
 
 		 465 aa  865    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  89.66 
 
 		 465 aa  864    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  86.21 
 
 		 464 aa  843    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  87.72 
 
 		 464 aa  855    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  89.44 
 
 		 465 aa  863    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  66.89 
 
 		 472 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  62.97 
 
 		 461 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  64.81 
 
 		 465 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  61.85 
 
 		 460 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  61.63 
 
 		 460 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  61.71 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  61.71 
 
 		 471 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  61.71 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  62.98 
 
 		 461 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  61.71 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  61.71 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  60.69 
 
 		 470 aa  586  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  61.71 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  61.49 
 
 		 471 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  61.71 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  61.49 
 
 		 471 aa  586  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  59.69 
 
 		 465 aa  578  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  59.43 
 
 		 467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  58.21 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  60.71 
 
 		 471 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  60.71 
 
 		 471 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  60.71 
 
 		 471 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  60.71 
 
 		 471 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  60.71 
 
 		 471 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  58.9 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  59.21 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  60 
 
 		 468 aa  564  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  59.56 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  58.99 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  59.78 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  59.34 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  59.78 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  58.55 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  58.55 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  59.96 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  58.86 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  59.16 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  59.34 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  59.34 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  58.93 
 
 		 451 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  59.34 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  61.17 
 
 		 472 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  59.06 
 
 		 478 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  59.34 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  58.9 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  58.9 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  58.68 
 
 		 468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  58.68 
 
 		 468 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  59.2 
 
 		 473 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  58.06 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  59.91 
 
 		 462 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  59.91 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  57.55 
 
 		 466 aa  551  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  60.09 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  58.21 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  59.08 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  60.04 
 
 		 470 aa  545  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  59.61 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  58 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  58.02 
 
 		 468 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  58.71 
 
 		 470 aa  538  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  57.97 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  58.23 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  58.23 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  59.16 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  58.23 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  58.23 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  58.23 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  57.97 
 
 		 461 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  58.23 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  58.23 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  58.6 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  58.23 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  57.79 
 
 		 460 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  57.36 
 
 		 460 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  57.58 
 
 		 460 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0550  replicative DNA helicase  57.91 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  57.58 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  57.36 
 
 		 460 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  57.58 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  57.92 
 
 		 462 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  56.67 
 
 		 462 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  56.12 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  56.12 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  55.73 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  57.37 
 
 		 469 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  58.05 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>