135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4905 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4905  ISPsy11, transposase OrfA  100 
 
 		 133 aa  273  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1877  ISPsy11, transposase OrfA  98.5 
 
 		 133 aa  266  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4510  ISPsy11, transposase OrfA  98.5 
 
 		 133 aa  266  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0069  ISPsy11, transposase OrfA  79.7 
 
 		 133 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1346  ISPsy11, transposase OrfA  79.7 
 
 		 133 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2031  ISPsy11, transposase OrfA  79.7 
 
 		 133 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2130  ISPsy11, transposase OrfA  79.7 
 
 		 133 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0726  ISPsy11, transposase OrfA  67.97 
 
 		 133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366028  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3377  ISPsy11, transposase OrfA  67.97 
 
 		 133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2058  ISPsy11, transposase OrfA  67.97 
 
 		 133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587475  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1089  ISPsy11, transposase OrfA  67.97 
 
 		 133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4795  ISPsy11, transposase OrfA  67.97 
 
 		 133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3677  ISPsy11, transposase OrfA  67.97 
 
 		 133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3381  ISPsy11, transposase OrfA  67.19 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0834  ISPsy11, transposase OrfA  67.19 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00573126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2127  ISPsy11, transposase OrfA  64.84 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0498042  hitchhiker  0.00573709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2143  response regulator receiver protein  64.84 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000143266  hitchhiker  0.000251162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2297  ISPsy11, transposase OrfA  64.84 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3302  ISPsy11, transposase OrfA  64.84 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2788  ISPsy11, transposase OrfA  65.29 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2673  ISPsy11, transposase OrfA  65.29 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3618  ISPsy11, transposase OrfA  65.29 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1120  ISPsy11, transposase OrfA  65.29 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123327  normal  0.37757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1019  ISPsy11, transposase OrfA  65.29 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00833205  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  63.2 
 
 		 405 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000799594  hitchhiker  0.000000166407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  63.2 
 
 		 405 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  63.2 
 
 		 405 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  63.2 
 
 		 405 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  63.2 
 
 		 405 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  63.2 
 
 		 405 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000171981  decreased coverage  0.0000000862956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1951  ISPsy11, transposase OrfA  64.75 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183596  normal  0.0546962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3220  ISPsy11, transposase OrfA  64.75 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3090  ISPsy11, transposase OrfA  63.78 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000160805  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0758  ISPsy11, transposase OrfA  63.78 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1225  ISPsy11, transposase OrfA  63.78 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0368564  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2076  IS3 family transposase orfA  55.3 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.045184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1272  transposase  59.43 
 
 		 116 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1556  transposase  46.27 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.19956  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2798  transposase  46.27 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.340793  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0340  transposase  46.27 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.487576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1549  transposase  46.27 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000548512  normal  0.103876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1644  transposase  46.27 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.520277 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2000  transposase  46.27 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.683542  hitchhiker  0.00023796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2067  transposase  46.27 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0302377  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3734  transposase  46.27 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.475497  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0465  transposase  55.65 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3339  transposase  55.65 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.880716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3563  transposase  55.65 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0435  transposase  46.32 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0644  transposase  46.32 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  hitchhiker  0.00011649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2116  transposase  46.32 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0016  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3127  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000627522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3981  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1757  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1912  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0701676  hitchhiker  0.0000000637024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2390  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.224522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2046  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0564097  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0573  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0389976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0682  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0798  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1018  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0189019  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1623  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1976  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0455365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2331  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2572  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000021064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3083  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4069  transposase  53.85 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4488  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0166047  normal  0.0142246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0934  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000418233  normal  0.0829612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2297  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000692881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2642  transposase  45.52 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0777  transposase  46.32 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0093  transposase  44.78 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1370  transposase  47.06 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2778  transposase  45.9 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3225  transposase  45.9 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3515  transposase  45.9 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3586  transposase  45.9 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.865682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3709  transposase  45.9 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1382  transposase  45.9 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4289  transposase  45.9 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1234  transposase  47.06 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1728  transposase  47.06 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000136689  normal  0.0656378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2587  transposase  47.06 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168791  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3306  transposase  47.06 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3491  transposase  47.06 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.503078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2603  transposase  45.9 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000501028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  45.9 
 
 		 409 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0716  putative transposase orfA  49.21 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0936  transposase orfA  47.37 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0870  transposase  46.96 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1674  transposase  46.96 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0282712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2987  transposase  46.96 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1880  transposase  45.69 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4442  transposase  45.69 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  45.08 
 
 		 411 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  45.08 
 
 		 411 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  45.08 
 
 		 411 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  45.08 
 
 		 411 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>