197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4854 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  84.07 
 
 		 294 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  62.16 
 
 		 293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  49.65 
 
 		 293 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  43.39 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  51.65 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  37.82 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  36.82 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  33.06 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  33.05 
 
 		 330 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  36.45 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  35.96 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  40.11 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  30.74 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  32.71 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  32.71 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  31.62 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  31.62 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  31.62 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  34.59 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  32.32 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  36.46 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  36.46 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  37.02 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  33.87 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 660 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  30.64 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  30.09 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  27.35 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 335 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  31.32 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  31.18 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  31.32 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.31 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 335 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  27.61 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  29.86 
 
 		 328 aa  93.2  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  23.33 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  24.13 
 
 		 323 aa  92.4  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  25 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 325 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  30.51 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.82 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  29.49 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 336 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  32.7 
 
 		 333 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 325 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  28.3 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  29.24 
 
 		 325 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 325 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 325 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  29.08 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  29.08 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  28.57 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  25.65 
 
 		 325 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  25 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  30.68 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  22.3 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  26.92 
 
 		 325 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  28.73 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  29.39 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  26.23 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  32.2 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  28.57 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  26.57 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>