More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4851 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  100 
 
 		 419 aa  841    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  87.83 
 
 		 416 aa  743    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  70.84 
 
 		 422 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  61.87 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  59.06 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  57.63 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  54.03 
 
 		 428 aa  398  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  46.27 
 
 		 483 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  39.07 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  41.16 
 
 		 468 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  41.85 
 
 		 441 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  41.3 
 
 		 454 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  41.12 
 
 		 441 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  41.12 
 
 		 441 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  41.12 
 
 		 441 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  41.12 
 
 		 441 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  41.4 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  41.4 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  41.4 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  39.95 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  40.69 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  40.26 
 
 		 492 aa  243  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  39.8 
 
 		 454 aa  242  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  39.05 
 
 		 473 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  40.1 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  39.85 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  41.82 
 
 		 443 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  41.82 
 
 		 443 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  41.82 
 
 		 443 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  39.39 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  39.39 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  39.15 
 
 		 443 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  35.48 
 
 		 469 aa  229  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  34.38 
 
 		 478 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 		 478 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  35.27 
 
 		 484 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  32.33 
 
 		 482 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  34.75 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  37.84 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  35.4 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  40.49 
 
 		 493 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  33.56 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  34.33 
 
 		 490 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  39.87 
 
 		 496 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  38.14 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  36.83 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  32.17 
 
 		 526 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  34.04 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  34.04 
 
 		 487 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  33.8 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  33.8 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  33.8 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  33.8 
 
 		 482 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  33.8 
 
 		 482 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  33.8 
 
 		 482 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  33.07 
 
 		 492 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  44.33 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  38.89 
 
 		 517 aa  173  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  39.85 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  39.08 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  31.73 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  32.65 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  37.77 
 
 		 475 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  37.41 
 
 		 478 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  39.46 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  32.91 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.13 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  40.15 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  32.9 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  29.52 
 
 		 473 aa  166  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  37.97 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  44.27 
 
 		 539 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  36.67 
 
 		 514 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  38.19 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  37.99 
 
 		 474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  40.22 
 
 		 507 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  33.16 
 
 		 620 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  37.55 
 
 		 530 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  36.1 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  36.82 
 
 		 652 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  31.92 
 
 		 571 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  38.49 
 
 		 633 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  36.82 
 
 		 656 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  39.92 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  35.79 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  37.98 
 
 		 642 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  37.98 
 
 		 646 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  37.98 
 
 		 642 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  36.86 
 
 		 690 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  36.86 
 
 		 690 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  36.86 
 
 		 690 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  35.61 
 
 		 657 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  37.89 
 
 		 679 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  31.2 
 
 		 479 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  29.67 
 
 		 483 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  35.44 
 
 		 497 aa  153  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  35.16 
 
 		 634 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  37.55 
 
 		 495 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  42.86 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>