More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4817 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  100 
 
 
445 aa  899    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  96.4 
 
 
445 aa  873    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  75.74 
 
 
440 aa  685    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  69.84 
 
 
438 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  69.16 
 
 
438 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  69.39 
 
 
438 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  70.75 
 
 
438 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  65.45 
 
 
438 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  62.39 
 
 
448 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  62.8 
 
 
448 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  58.5 
 
 
427 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  63.76 
 
 
418 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  48 
 
 
415 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  49.46 
 
 
421 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  46.19 
 
 
413 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  51.61 
 
 
430 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  49.46 
 
 
455 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  50.27 
 
 
417 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  49.19 
 
 
417 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  48.45 
 
 
409 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  48.61 
 
 
474 aa  363  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  49.19 
 
 
419 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  45.19 
 
 
435 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  50.4 
 
 
438 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 
434 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  48.1 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  51.34 
 
 
424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  48.59 
 
 
457 aa  355  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  46.28 
 
 
464 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  48.79 
 
 
470 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  48.94 
 
 
454 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  47.78 
 
 
464 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  51.87 
 
 
390 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  45.5 
 
 
432 aa  348  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  45.7 
 
 
461 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  48.28 
 
 
418 aa  346  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  47.58 
 
 
413 aa  345  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  45.58 
 
 
470 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  48.53 
 
 
413 aa  345  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  46.32 
 
 
422 aa  342  8e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  46.01 
 
 
451 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  44.68 
 
 
469 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  46.92 
 
 
398 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  48.14 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  45.09 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  44.56 
 
 
409 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  45.84 
 
 
398 aa  336  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  46.51 
 
 
404 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  47.54 
 
 
400 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  48.41 
 
 
429 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  49.6 
 
 
423 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  46.56 
 
 
398 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  45.02 
 
 
412 aa  331  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  46.5 
 
 
398 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  46.76 
 
 
398 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  46.3 
 
 
398 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  46.11 
 
 
398 aa  329  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  45.13 
 
 
443 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  46.92 
 
 
514 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  46.93 
 
 
720 aa  322  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  45.24 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 
406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  46.76 
 
 
400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  43.87 
 
 
412 aa  318  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.42 
 
 
462 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  46.15 
 
 
411 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 
413 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  44.25 
 
 
430 aa  316  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  47.45 
 
 
392 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  44.18 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 
393 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  46.54 
 
 
405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  40.45 
 
 
410 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  48.4 
 
 
391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  45.62 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  44.3 
 
 
425 aa  303  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  43.2 
 
 
395 aa  300  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  42.59 
 
 
405 aa  299  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  42.21 
 
 
407 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  45.19 
 
 
419 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  43.12 
 
 
407 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.7 
 
 
421 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 
395 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  42.48 
 
 
416 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  41.41 
 
 
433 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  47.29 
 
 
486 aa  285  8e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  40.92 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  46.38 
 
 
490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  46.38 
 
 
491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  41.16 
 
 
381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  38.67 
 
 
445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  37.18 
 
 
428 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  43.5 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.82 
 
 
434 aa  282  9e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  39.41 
 
 
395 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  38.5 
 
 
415 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  41.01 
 
 
396 aa  280  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  36.97 
 
 
430 aa  279  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  36.88 
 
 
438 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>