More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4781 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4781  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4330  hypothetical protein  84.69 
 
 
297 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2239  esterase/lipase/thioesterase  66.13 
 
 
322 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5823  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.48 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3349  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.4 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3477  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.6 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3153  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.6 
 
 
316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.566482  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0472  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.25 
 
 
322 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3261  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.26 
 
 
316 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0540  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.77 
 
 
318 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1452  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.87 
 
 
318 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4532  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.92 
 
 
316 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.472069  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6392  hypothetical protein  36.42 
 
 
220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.09 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.97 
 
 
311 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.73 
 
 
313 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.31 
 
 
229 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149419  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  33.83 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
325 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.6 
 
 
289 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.33 
 
 
312 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1001  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.53 
 
 
311 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.35 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.86 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2140  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.28 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.14 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.75 
 
 
316 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.42 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.46 
 
 
308 aa  89.4  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.73 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  31.64 
 
 
309 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  32.05 
 
 
444 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06580  esterase/lipase  33.08 
 
 
316 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.22 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0567  acetyl esterase  25.82 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6232  esterase/lipase/thioesterase  31.73 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.3 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4466  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.05 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.13 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0542  acetyl esterase  25.37 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.17 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  32.93 
 
 
310 aa  86.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0537  acetyl esterase  25.37 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.8 
 
 
382 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.39 
 
 
347 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3134  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.82 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.999028  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1415  heroin esterase  29.84 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0841271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.28 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0519  acetyl esterase  25.82 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0552  acetyl esterase  24.63 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0553  acetyl esterase  25.41 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4715  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.19 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3140  acetyl esterase  25.41 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.848607  hitchhiker  0.00168444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.17 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  32.05 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00427  acetyl esterase  25.41 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.13 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00432  hypothetical protein  25.41 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2458  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.99 
 
 
483 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.53 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0536  acetyl esterase  24.63 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.28 
 
 
314 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.77 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2733  carboxylesterase  28.29 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0800200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0407  acetyl esterase  25.41 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4350  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.79 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00963148  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0514  acetyl esterase  25 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.92 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  31.69 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  31.3 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.75 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.93 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08242  lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03770)  32.77 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal  0.153385 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  34.47 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  29.72 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.98 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.42 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  31.29 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  33.63 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.5 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.45 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.38 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.45 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.26 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.8 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  31.6 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.02 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  29.33 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.52 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.48 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.1 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  31.07 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.28 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.23 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05501  lipase/esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01050)  30.33 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.737319  normal  0.319668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  32.18 
 
 
884 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.36 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.73 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3668  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.19 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>