30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4742 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 682 aa  1424    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2777  hypothetical protein  25.58 
 
 		 531 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0685332  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4956  hypothetical protein  25.58 
 
 		 619 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.573835 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7605  hypothetical protein  24.32 
 
 		 631 aa  120  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0248  integrase family protein  24.64 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7326  integrase family protein  24.64 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677139  hitchhiker  0.00388459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6480  integrase family protein  24.64 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2364  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.13 
 
 		 729 aa  74.3  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  22.43 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 694 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  25.12 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  25.12 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  24.04 
 
 		 707 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  29.2 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  24.14 
 
 		 717 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  24.52 
 
 		 616 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 600 aa  48.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 600 aa  48.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.27 
 
 		 650 aa  47.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.78 
 
 		 617 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  26.26 
 
 		 714 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  21.69 
 
 		 680 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  21.69 
 
 		 680 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 236 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  43.1 
 
 		 533 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  24.34 
 
 		 741 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.63 
 
 		 650 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  28.02 
 
 		 721 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.4 
 
 		 650 aa  45.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  38.98 
 
 		 606 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>