283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4697 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4697  ISPs1, transposase OrfB  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  65.38 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  63.46 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  63.46 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  58.1 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0751  ISPs1, transposase OrfB  72.13 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  57.63 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  55.93 
 
 		 429 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.55 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  38.53 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.55 
 
 		 281 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  42.53 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  42.53 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  37.61 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  37.61 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  36.7 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  36.7 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  36.7 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  36.7 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  36.7 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  37.5 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  36.7 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  36.54 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  36.54 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  38.14 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  38.14 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  38.14 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  41.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  38.14 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.55 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  40.48 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  40.91 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  33.64 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  34.83 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  37.27 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  40.23 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  40.23 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  40.23 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  40.23 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  38.1 
 
 		 95 aa  57  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  35.19 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  38.1 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  38.1 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  38.1 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  38.1 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  38.37 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  38.1 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  33.93 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  33.93 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  36.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  36.67 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  38.55 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  39.29 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  35.45 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  29.89 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  29.89 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  29.89 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  38.89 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  38.89 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  40.48 
 
 		 266 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  30.59 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  37.78 
 
 		 260 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  37.78 
 
 		 260 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  30.59 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33330  transposase IS4 family  35.63 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49850  transposase IS4 family  35.63 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.102835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15010  transposase IS4 family  35.63 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23940  transposase IS4 family  35.63 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09580  transposase IS4 family  35.63 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.899796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10840  transposase IS4 family  35.63 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36160  transposase IS4 family  35.63 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  37.35 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  37.35 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  37.35 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  43.24 
 
 		 273 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  37.35 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  34.95 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  34.95 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  34.95 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  37.35 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  32.18 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  32.56 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  32.18 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  32.56 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  37.35 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  32.18 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  32.56 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  32.18 
 
 		 336 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>