More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4551 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 577 aa  1182    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  90.56 
 
 		 572 aa  1008    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  73.57 
 
 		 575 aa  895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  49.13 
 
 		 636 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  49.12 
 
 		 621 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  50.18 
 
 		 578 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  49.1 
 
 		 589 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  48.56 
 
 		 589 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  48.92 
 
 		 589 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  48.92 
 
 		 589 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  48.55 
 
 		 588 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  51.1 
 
 		 606 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  48.74 
 
 		 589 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  46.7 
 
 		 586 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  47.45 
 
 		 583 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  48.56 
 
 		 589 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  47.63 
 
 		 630 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  48.38 
 
 		 614 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  48.2 
 
 		 614 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  48.38 
 
 		 589 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  47.04 
 
 		 579 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  48.56 
 
 		 614 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  46.29 
 
 		 613 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  47.84 
 
 		 592 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  46.38 
 
 		 593 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.63 
 
 		 588 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  47.66 
 
 		 583 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 588 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 588 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.66 
 
 		 584 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 588 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.48 
 
 		 588 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 588 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  46.41 
 
 		 614 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.66 
 
 		 588 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  44.17 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  43.59 
 
 		 590 aa  484  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  45.92 
 
 		 610 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  45.52 
 
 		 588 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  43.58 
 
 		 587 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.58 
 
 		 587 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  44.23 
 
 		 595 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  42.3 
 
 		 596 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  43.73 
 
 		 596 aa  439  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  43.26 
 
 		 708 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  42.7 
 
 		 704 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  40.55 
 
 		 563 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  42.7 
 
 		 704 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  42.7 
 
 		 712 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  40.7 
 
 		 701 aa  422  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  41.49 
 
 		 602 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  41.21 
 
 		 605 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  41.74 
 
 		 626 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  41.55 
 
 		 615 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  40.53 
 
 		 712 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  38.35 
 
 		 595 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  41.7 
 
 		 713 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  40.62 
 
 		 606 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.87 
 
 		 598 aa  395  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.58 
 
 		 599 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  36.22 
 
 		 660 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  39.89 
 
 		 597 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  35.88 
 
 		 651 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  38.41 
 
 		 603 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  34.81 
 
 		 642 aa  359  6e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  35.52 
 
 		 674 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  35.18 
 
 		 666 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  38.25 
 
 		 557 aa  353  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  36.41 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  37.89 
 
 		 553 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  33.68 
 
 		 639 aa  345  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  35.33 
 
 		 591 aa  345  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  33.68 
 
 		 636 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  38.21 
 
 		 557 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  34.3 
 
 		 636 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  34.3 
 
 		 634 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  33.68 
 
 		 635 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  36.82 
 
 		 609 aa  333  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  37.96 
 
 		 560 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 		 549 aa  323  6e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  34.85 
 
 		 621 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  34.87 
 
 		 626 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  37.57 
 
 		 603 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  36.06 
 
 		 606 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  35.14 
 
 		 561 aa  320  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  33.74 
 
 		 633 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  34.95 
 
 		 561 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  33.88 
 
 		 616 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  34.77 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  34.77 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  34.77 
 
 		 561 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  34.77 
 
 		 561 aa  317  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  34.68 
 
 		 629 aa  316  9e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  34.39 
 
 		 561 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  34.39 
 
 		 561 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  37.13 
 
 		 667 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  33.51 
 
 		 637 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  33.75 
 
 		 608 aa  313  6.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 		 561 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  33.27 
 
 		 534 aa  306  7e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>