More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4550 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  98.8 
 
 		 249 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  89.47 
 
 		 274 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  84.03 
 
 		 251 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  77.91 
 
 		 249 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  77.73 
 
 		 249 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  77.73 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  77.73 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  79.84 
 
 		 252 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  65.73 
 
 		 253 aa  314  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  64.11 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  64.11 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  64.11 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  65.97 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  65.97 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  65.97 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  64.78 
 
 		 273 aa  285  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  61.89 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  63.03 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  61.3 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 268 aa  271  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  57.02 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  56.35 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  58.47 
 
 		 268 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  54.73 
 
 		 247 aa  254  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  53.53 
 
 		 248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  57.45 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  56.41 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  50.81 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  59.49 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  50.41 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  49.8 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  54.66 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  53.39 
 
 		 237 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  51.75 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  49.35 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  50.42 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  50.42 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  50 
 
 		 242 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  44.63 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  40.09 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  39.38 
 
 		 248 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  44.3 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  39.5 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  38.56 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 240 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  38.79 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  40.09 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  42.22 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  37.93 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  38.84 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  42.79 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  40.52 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  39.13 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  36.91 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  36.91 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  40.17 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  34.5 
 
 		 241 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.92 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  40.95 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  34.96 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  38.16 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32950  transcriptional regulator, GntR family  52.59 
 
 		 143 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982848  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  36.1 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  37.28 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  35.61 
 
 		 215 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  35.56 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  37.55 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  35.92 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>