More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4548 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  78.9 
 
 		 453 aa  732    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  79.33 
 
 		 454 aa  731    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  100 
 
 		 461 aa  927    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  98.26 
 
 		 461 aa  917    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  85.03 
 
 		 468 aa  797    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  78.92 
 
 		 463 aa  731    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  78.07 
 
 		 454 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  79.33 
 
 		 454 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  66.97 
 
 		 445 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  64.99 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  65.77 
 
 		 457 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  67.05 
 
 		 451 aa  611  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  64.76 
 
 		 450 aa  610  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  64.99 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  64.49 
 
 		 452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  64.99 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  64.99 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  64.99 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  64.49 
 
 		 452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  64.99 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  64.49 
 
 		 452 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  64.99 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  64.49 
 
 		 452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  64.49 
 
 		 452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  64.99 
 
 		 450 aa  601  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  64.76 
 
 		 450 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  64.99 
 
 		 440 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  65.53 
 
 		 450 aa  594  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  62.05 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  62.05 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  62.05 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  62.05 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  62.05 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  63.1 
 
 		 458 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  62.05 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  64.91 
 
 		 453 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  62.05 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  62.19 
 
 		 444 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  64.92 
 
 		 450 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  65.45 
 
 		 450 aa  586  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  64.53 
 
 		 451 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  67.05 
 
 		 451 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  60.54 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  61.19 
 
 		 450 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  66.06 
 
 		 450 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  61.87 
 
 		 450 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  66.06 
 
 		 450 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  62.47 
 
 		 446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  59.11 
 
 		 485 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  62.02 
 
 		 446 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  59.33 
 
 		 485 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  61.56 
 
 		 446 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  61.56 
 
 		 446 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  62.24 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  58.56 
 
 		 458 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  58.78 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0277  d-galactonate transporter  62.7 
 
 		 446 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370556 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  57.91 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2810  D-galactonate transporter  62.47 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  57.91 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0296  d-galactonate transporter  62.47 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106935  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4946  d-galactonate transporter  58.85 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.899086  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  52.91 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  50.92 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  53.61 
 
 		 447 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  50.69 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  50.69 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 454 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 455 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  49.2 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  47.5 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  47.5 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  47.5 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  47.5 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  42.86 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  43.32 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.56 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  43.09 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  43.25 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  43.02 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  43.02 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  44.11 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  43.02 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  43.55 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  43.32 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  43.55 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  41.8 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  43.02 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  42.79 
 
 		 430 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  42.79 
 
 		 430 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>