More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4385 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  60.41 
 
 		 680 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  52.72 
 
 		 675 aa  685    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 763 aa  1577    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  67.98 
 
 		 678 aa  925    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  68.69 
 
 		 680 aa  937    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  65.72 
 
 		 702 aa  906    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  51.71 
 
 		 689 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  54.83 
 
 		 671 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  69.3 
 
 		 680 aa  931    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  63.8 
 
 		 968 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  79.82 
 
 		 684 aa  1134    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  67.37 
 
 		 741 aa  895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  65.56 
 
 		 694 aa  908    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  63.72 
 
 		 693 aa  913    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  63.71 
 
 		 808 aa  885    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  66.06 
 
 		 688 aa  889    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  67.17 
 
 		 680 aa  915    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  59.86 
 
 		 790 aa  855    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  67.53 
 
 		 680 aa  919    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  47.52 
 
 		 675 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  45.95 
 
 		 691 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  45.47 
 
 		 1118 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  40.48 
 
 		 706 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  38.91 
 
 		 694 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  39.73 
 
 		 1017 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  39.74 
 
 		 1095 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  39.88 
 
 		 723 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  39.5 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  39.5 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  39.5 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  36.35 
 
 		 682 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  36.91 
 
 		 678 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.92 
 
 		 683 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  36.84 
 
 		 727 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.61 
 
 		 683 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  34.52 
 
 		 692 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  32.63 
 
 		 771 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  35.99 
 
 		 678 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  37.16 
 
 		 656 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  36.05 
 
 		 694 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  36.56 
 
 		 699 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  32.89 
 
 		 692 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  36 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  34.87 
 
 		 740 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  35.75 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 		 740 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  33.03 
 
 		 741 aa  363  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  33.03 
 
 		 741 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 		 697 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  38.6 
 
 		 732 aa  357  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  35.12 
 
 		 616 aa  357  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  39.19 
 
 		 706 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  35.76 
 
 		 706 aa  355  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  35.22 
 
 		 615 aa  355  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  33.58 
 
 		 771 aa  354  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  35.06 
 
 		 722 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  36.05 
 
 		 741 aa  351  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  34.18 
 
 		 722 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  37.69 
 
 		 609 aa  349  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  32.09 
 
 		 754 aa  348  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  32.11 
 
 		 754 aa  346  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  34.43 
 
 		 619 aa  346  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  31.73 
 
 		 709 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  34.24 
 
 		 617 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  33.06 
 
 		 618 aa  345  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  35.38 
 
 		 741 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  33.75 
 
 		 617 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  35.92 
 
 		 646 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  33.59 
 
 		 617 aa  344  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  34.34 
 
 		 618 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  36.15 
 
 		 756 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  36.3 
 
 		 748 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  33.14 
 
 		 722 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  36.52 
 
 		 774 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  33.03 
 
 		 725 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  36.13 
 
 		 788 aa  337  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  32.53 
 
 		 725 aa  337  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  35.28 
 
 		 643 aa  336  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  36.78 
 
 		 572 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  37.28 
 
 		 907 aa  333  9e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  34.52 
 
 		 617 aa  333  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  36.26 
 
 		 755 aa  332  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  32.68 
 
 		 726 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  35.65 
 
 		 778 aa  329  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  35.16 
 
 		 794 aa  329  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  35.87 
 
 		 668 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  33.44 
 
 		 610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  34.66 
 
 		 748 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  35.6 
 
 		 689 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  34.36 
 
 		 697 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  33.44 
 
 		 741 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  34.09 
 
 		 669 aa  318  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  32.62 
 
 		 692 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  35.04 
 
 		 792 aa  317  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  33.13 
 
 		 767 aa  317  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  34.16 
 
 		 668 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  33.08 
 
 		 767 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  33.64 
 
 		 668 aa  313  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  35.59 
 
 		 689 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  36.65 
 
 		 616 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>