138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4379 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4379  cytoplasmic membrane family protein  100 
 
 		 164 aa  323  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4074  FxsA  95.86 
 
 		 164 aa  258  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  65.45 
 
 		 153 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  65.45 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  65.45 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  57.62 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  57.62 
 
 		 155 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  64.38 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  60.74 
 
 		 149 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0966  FxsA  61.9 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.778639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.8 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.04 
 
 		 196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13450  FxsA  54.11 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.58 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.34 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.93 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.8 
 
 		 217 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.33 
 
 		 202 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.33 
 
 		 202 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.42 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.33 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.93 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  50.49 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.14 
 
 		 191 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  34.57 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.27 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.76 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  38.46 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  34.86 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  32.73 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  32.73 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  35.58 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  49.02 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.21 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.64 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.32 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  38.98 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.62 
 
 		 205 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  38.98 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  44.79 
 
 		 191 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  32 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.02 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.87 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.16 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.74 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.81 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.36 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.56 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  36.44 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  32.79 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  34.75 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.75 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  36.29 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.75 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.75 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.91 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  30.23 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  34.75 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  34.75 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  34.75 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  34.75 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.08 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.67 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.58 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.9 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.19 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.16 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.38 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  30.91 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1845  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.86 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  30.38 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1039  fxsA protein  35.95 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  29.03 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  29.03 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.12 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.24 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.01 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.38 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.77 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.3 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  35.34 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.9 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3107  FxsA cytoplasmic membrane protein  43.96 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00439581 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  40.91 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  39.19 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.5 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  37.04 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  37.04 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  37.04 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  36.05 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.44 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.16 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.33 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.41 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.21 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2675  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.88 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546891  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.13 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.78 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0805  cytoplasmic membrane protein FsxA  44.23 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.399076  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  37.96 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>