More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4354 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4354  acyltransferase domain protein  100 
 
 
268 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4049  phospholipid/glycerol acyltransferase  94.4 
 
 
264 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1286  lyso-ornithine lipid acyltransferase  74.22 
 
 
264 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0962  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.78 
 
 
262 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56375  normal  0.0837796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0923  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.97 
 
 
262 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4923  putative acyltransferase  69.38 
 
 
258 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56570  putative acyltransferase  70.87 
 
 
258 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.501809  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4465  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.78 
 
 
262 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.0348666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0989  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.59 
 
 
262 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1125  lyso-ornithine lipid acyltransferase  62.77 
 
 
257 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.801082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37770  Phospholipid/glycerol acyltransferase protein  60.48 
 
 
256 aa  278  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2735  lyso-ornithine lipid acyltransferase  44.44 
 
 
256 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2323  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.49 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1899  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.5 
 
 
259 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.42 
 
 
290 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0653841  normal  0.746167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1867  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.41 
 
 
272 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603532  normal  0.936016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1080  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.79 
 
 
246 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0356  lyso-ornithine lipid acyltransferase  38.92 
 
 
266 aa  143  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0397  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.92 
 
 
266 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3453  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.61 
 
 
277 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.347441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0468  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0186334  normal  0.735375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0058  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  38.46 
 
 
255 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03575  acetyltransferase  35.32 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3957  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.36 
 
 
241 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00230102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0103  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.97 
 
 
263 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0143451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0912  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.63 
 
 
245 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.427202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0742  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.84 
 
 
285 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.21 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3933  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.1 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0572  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.41 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3143  acyltransferase domain-containing protein  34.29 
 
 
289 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0921  acyltransferase domain-containing protein  34.29 
 
 
289 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0875  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.08 
 
 
300 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342113  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1854  acyltransferase domain-containing protein  34.29 
 
 
289 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1992  acyltransferase family protein  34.29 
 
 
289 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.60533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2751  acyltransferase family protein  34.29 
 
 
289 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3165  acyltransferase family protein  34.29 
 
 
289 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0727  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.08 
 
 
299 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1467  acyltransferase domain-containing protein  35.11 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3107  acyltransferase domain-containing protein  37.71 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2037  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.62 
 
 
255 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1584  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.49 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0624  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.93 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3806  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.47 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2738  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.55 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0875  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.93 
 
 
281 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.58 
 
 
273 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0169  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.94 
 
 
273 aa  115  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0915233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0502  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.62 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2152  acyltransferase, putative  31.82 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2519  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.27 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0840  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.33 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90498  hitchhiker  0.00272308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0680  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase transmembrane protein  32.67 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3967  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.36 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.930153  normal  0.606855 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3343  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  33.47 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0189136  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2322  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.01 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0387  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.33 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0869  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.33 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.788185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.89 
 
 
285 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541169 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2065  putative acyltransferase  33.48 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0207  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.04 
 
 
225 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2891  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.23 
 
 
246 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1583  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.77 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.867184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3568  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.02 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.66 
 
 
253 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4612  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.1 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1147  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.65 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3918  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.09 
 
 
262 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.599966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.77 
 
 
267 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3827  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.62 
 
 
246 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2386  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.47 
 
 
241 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3520  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.32 
 
 
274 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.808003  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3808  hypothetical protein  35.75 
 
 
287 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.164896  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1512  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.35 
 
 
252 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808904  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1819  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.13 
 
 
271 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3391  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.83 
 
 
298 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3201  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.61 
 
 
292 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.777039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1289  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.16 
 
 
282 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1122  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.76 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.989622  normal  0.329489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3525  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.61 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337156  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1653  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.76 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4256  phospholipid/glycerol acyltransferase  30 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4813  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.98 
 
 
282 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3769  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.54 
 
 
319 aa  95.5  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.158826  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1209  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.2 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.985535  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2104  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.81 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6048  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.07 
 
 
330 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3397  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.94 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4432  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.84 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0698  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.63 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3930  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.62 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.922755  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0020  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.7 
 
 
265 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.398753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2435  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.01 
 
 
278 aa  92  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.52219  normal  0.0144042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1874  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.18 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1920  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.18 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141545  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1854  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.18 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0436  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.7 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3257  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.75 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0039  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.11 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000361849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0032  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.12 
 
 
265 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.171039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>