33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4322 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1260    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  49.8 
 
 
533 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.52 
 
 
617 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  28.27 
 
 
600 aa  190  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  28.27 
 
 
600 aa  190  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.44 
 
 
650 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.82 
 
 
650 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  25.88 
 
 
688 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.39 
 
 
650 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  39.34 
 
 
236 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  27.85 
 
 
616 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1212  phage integrase family protein  31.99 
 
 
392 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  22.64 
 
 
568 aa  72.8  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  20.99 
 
 
707 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  20.4 
 
 
683 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  20.4 
 
 
683 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  23.58 
 
 
741 aa  61.2  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  22.83 
 
 
717 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  28.51 
 
 
714 aa  57  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  20.97 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  20.97 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  20.97 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  20.97 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  20.97 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  20.97 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  22.82 
 
 
724 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  22.82 
 
 
724 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  22.82 
 
 
724 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  28.87 
 
 
289 aa  48.5  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  25.63 
 
 
721 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0071  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.04 
 
 
700 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  32.18 
 
 
694 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  38.98 
 
 
682 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>