113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4266 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.19 
 
 		 295 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  50.88 
 
 		 286 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 283 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  51.65 
 
 		 285 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  48.38 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  48.7 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  49.07 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  46.07 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  47.86 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  48.24 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  46.69 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  48.04 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  50.54 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  46.57 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  48.13 
 
 		 290 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  53.9 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  47.35 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  42.52 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  44.03 
 
 		 314 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  46.15 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  46.1 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  53.74 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  40.6 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  48.33 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  44.33 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  55.21 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  56.37 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  37.97 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  42.71 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  39.77 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  44.49 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.64 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  39.78 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  39.41 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  46.91 
 
 		 194 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  44.66 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  41.88 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  38.25 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  42.69 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.82 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  25.85 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  25.85 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  25.85 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.76 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  25.24 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  25.37 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  31.68 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  25.24 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  25.24 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  26.02 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  26.02 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  26.02 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  25.12 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  25.51 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.51 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.41 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  29.55 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  25 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  25 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  24.29 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  26.25 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.65 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  25.11 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  23.66 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  25 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  25 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  25 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  24.31 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  25.94 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  25.94 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  25.94 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  25.94 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  25.94 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  25.94 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 325 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.94 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  25.94 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  23.23 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  23.23 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  23.23 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  23.23 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  24.88 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  27.36 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  22.73 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  24.26 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>