More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4156 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  100 
 
 		 301 aa  620  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  97.67 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  76.49 
 
 		 302 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  70 
 
 		 313 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  69.8 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  68.73 
 
 		 308 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  71.28 
 
 		 324 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  67.35 
 
 		 315 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  68.54 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  67.88 
 
 		 321 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  34.73 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  34.85 
 
 		 322 aa  178  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  36.4 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  29.9 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  29.66 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  28.32 
 
 		 287 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  31.09 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  28.01 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  30.5 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  28.62 
 
 		 290 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  27.3 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.93 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  28.62 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  28.97 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  27.59 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  28.42 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  28.85 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  28.2 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  26.53 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  27.82 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  29.5 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  26.81 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  27.68 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.44 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  27.31 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.35 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  29.75 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  24.73 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.92 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  41.38 
 
 		 670 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  23.9 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 		 638 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  31.65 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  36.21 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.62 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  42 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  42 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  42 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  41.84 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  42 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 		 679 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  42 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  35.71 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  42 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.08 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  42 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.36 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  36.44 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 630 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  29.46 
 
 		 543 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.76 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  42 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  35.58 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  41.58 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  35.29 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.96 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  47.22 
 
 		 490 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  29.19 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  34.45 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.11 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.89 
 
 		 205 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  36.17 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.36 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>