33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4154 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4154  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  186  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4883  transcriptional regulator MvaT  37.21 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2532  hypothetical protein  39.51 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56070  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  37.21 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0979321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2921  H-NS family protein MvaT  43.94 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0220889  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3313  H-NS family protein MvaT  41.67 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.724808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29590  putative transcriptional regulator  38.27 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.656804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4357  hypothetical protein  35.71 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.00000000000135149  normal  0.0272701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4448  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  35.71 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000222895  hitchhiker  0.00000983981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4437  H-NS family protein MvaT  41.67 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00708385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1006  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  40 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000105934  hitchhiker  0.0000000000004027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1366  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  35.29 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000478135  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4315  transcriptional regulator, putative  41.67 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000286205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4019  transcriptional regulator, putative  41.67 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000036562  normal  0.0246266 
 
 
 
NC_012560  Avin_38310  Transcriptional regulator MvaT  41.67 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0396822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4755  hypothetical protein  36.71 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2971  transcriptional regulator, putative  40.58 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0855395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3103  transcriptional regulator, putative  39.13 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000951367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2102  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  39.47 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.313756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3014  hypothetical protein  34.88 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4794  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2138  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  38.16 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000737433  hitchhiker  0.00000269456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2795  H-NS family protein MvaT  38.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3765  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  35.71 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3337  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1652  H-NS family protein MvaT  35.48 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1634  hypothetical protein  39.66 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0882393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1998  hypothetical protein  34.52 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.989293  hitchhiker  0.000130496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0128  hypothetical protein  32.86 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0281  hypothetical protein  36.67 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4167  hypothetical protein  34.88 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189495  normal  0.273328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2947  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  35 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194319  normal  0.217791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3693  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  30.67 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  decreased coverage  0.000194447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>