More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4146 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  86.54 
 
 		 364 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  100 
 
 		 364 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  96.7 
 
 		 364 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  87.09 
 
 		 364 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  87.36 
 
 		 364 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  86.81 
 
 		 364 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  87.36 
 
 		 364 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  80.49 
 
 		 362 aa  598  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  78.57 
 
 		 364 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19065  hypothetical protein  78.3 
 
 		 364 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0441543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  73.28 
 
 		 364 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  60.97 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  59.05 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  54.25 
 
 		 363 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  56.04 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  55.56 
 
 		 356 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  55.52 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  55.52 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  55.65 
 
 		 361 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  53.02 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.87 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  54.65 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  56.73 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  54.65 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  53.74 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  53.74 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.21 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  52.25 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.21 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  57.88 
 
 		 362 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  55.46 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  52.2 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  56.73 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  52.2 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  54.89 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  50.83 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  52.08 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  54.89 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  52.62 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  52.62 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  61.79 
 
 		 286 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.88 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.59 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.59 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.59 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  56.25 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  54.05 
 
 		 365 aa  362  6e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.29 
 
 		 363 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.29 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  48.9 
 
 		 374 aa  359  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  54.11 
 
 		 363 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  51.56 
 
 		 363 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  50.99 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.09 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  53.44 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.09 
 
 		 371 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  53.09 
 
 		 371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.09 
 
 		 371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.09 
 
 		 371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  54.2 
 
 		 362 aa  352  7e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.65 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.09 
 
 		 371 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.09 
 
 		 371 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.09 
 
 		 371 aa  348  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.09 
 
 		 371 aa  348  7e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  55.95 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  55.95 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  55.95 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  55.95 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  55.95 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  55.95 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  55.95 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  53.82 
 
 		 363 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  55.95 
 
 		 362 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  52.07 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2048  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  50.14 
 
 		 370 aa  342  7e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.912388  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  50.28 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.34 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2397  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.1 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.183831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1574  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.48 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  49.58 
 
 		 376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  47.34 
 
 		 373 aa  332  8e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  48.59 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  62.75 
 
 		 285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  58.4 
 
 		 369 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  48.7 
 
 		 369 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  48.13 
 
 		 369 aa  325  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1918  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.69 
 
 		 371 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1574  putative ATPase  49.58 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.473221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  59.54 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  59.54 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  59.54 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  59.54 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  59.54 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  59.54 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  59.54 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  59.54 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  59.54 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  46.46 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>