178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4073 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  100 
 
 		 410 aa  848    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  74.82 
 
 		 409 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  75.79 
 
 		 409 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  73.9 
 
 		 410 aa  649    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  80.93 
 
 		 410 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  79.46 
 
 		 410 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  82.4 
 
 		 412 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  82.4 
 
 		 412 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  75.85 
 
 		 409 aa  667    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  78.05 
 
 		 410 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  80.2 
 
 		 409 aa  680    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  76.77 
 
 		 409 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  80.68 
 
 		 410 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  82.4 
 
 		 412 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  75.06 
 
 		 409 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  81.17 
 
 		 410 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  80.49 
 
 		 409 aa  692    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  75.06 
 
 		 409 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  75.12 
 
 		 409 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  73.9 
 
 		 409 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  74.63 
 
 		 409 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  75.06 
 
 		 410 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  69.78 
 
 		 411 aa  614  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  66.75 
 
 		 406 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  66.83 
 
 		 408 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  69 
 
 		 408 aa  549  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  61.58 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  58.19 
 
 		 414 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  57.32 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  56.4 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  56.85 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  55.39 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  54.46 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  54.46 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  54.22 
 
 		 417 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  54.7 
 
 		 417 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  54.44 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  54.66 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  52.17 
 
 		 451 aa  431  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  52.27 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  53.47 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  51.33 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  50.36 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  46.39 
 
 		 401 aa  329  7e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  58.24 
 
 		 206 aa  226  8e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  36.41 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  32.81 
 
 		 459 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  34.37 
 
 		 388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.61 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  28.39 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  27.69 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  29.65 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  29.65 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.08 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  29.11 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  27.79 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  26.63 
 
 		 312 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  28.77 
 
 		 314 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  25.82 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  30 
 
 		 224 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  25.6 
 
 		 313 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  28.96 
 
 		 314 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  29.56 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  25.93 
 
 		 301 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  30.19 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  26.33 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  28.92 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  26.64 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 791 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  26.64 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.38 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  27.38 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  27.38 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  30.32 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  31.63 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.73 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  28.91 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  24.31 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  30.74 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  28.85 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  26.8 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  28.28 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.39 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  28.7 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  28.51 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  26.39 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  26.98 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  31.27 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  28.35 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.76 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  28.62 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  24.9 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  30.71 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  29.41 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 791 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  28.62 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  28.62 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  28.62 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  25.57 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  26.25 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>