More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3808 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  99.79 
 
 		 486 aa  1013    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  99.79 
 
 		 486 aa  1013    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  99.79 
 
 		 486 aa  1013    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  99.79 
 
 		 486 aa  1013    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  100 
 
 		 486 aa  1015    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  100 
 
 		 486 aa  1015    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  100 
 
 		 486 aa  1015    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  99.79 
 
 		 486 aa  1013    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  99.79 
 
 		 486 aa  1013    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  100 
 
 		 486 aa  1015    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  100 
 
 		 486 aa  1015    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  100 
 
 		 486 aa  1015    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  99.79 
 
 		 486 aa  1013    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  87.76 
 
 		 472 aa  871    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  85.02 
 
 		 472 aa  847    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  85.02 
 
 		 472 aa  847    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  45.19 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  43.88 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  43.88 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  41.6 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  41.6 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  41.75 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  40.59 
 
 		 478 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  41.34 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  40.38 
 
 		 478 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  42.86 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  43.07 
 
 		 478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  39.24 
 
 		 473 aa  353  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  38.82 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  42.98 
 
 		 479 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  42.98 
 
 		 479 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  42.41 
 
 		 497 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  42.41 
 
 		 497 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  39 
 
 		 499 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  44.01 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  40.68 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  37.36 
 
 		 351 aa  223  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  48.39 
 
 		 195 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  49.21 
 
 		 251 aa  196  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  40.86 
 
 		 275 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  40.87 
 
 		 249 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  52.6 
 
 		 150 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1383  putative transposase or inactivated derivative  27.38 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3038  IS4 family transposase  27.38 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3052  IS4 family transposase  27.38 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0529  putative transposase  27.52 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0534  putative transposase  27.33 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  27 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  28.77 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  31.4 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  31.1 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0217  ISBma2, transposase  27.37 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  25.65 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0251  ISBma2, transposase  27.37 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1524  transposase  27.16 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  27.37 
 
 		 493 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3521  transposase  27.64 
 
 		 482 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3216  ISBma2, transposase  27.64 
 
 		 487 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.450921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0108  ISBma2, transposase  27.66 
 
 		 493 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.745289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0203  ISBma2, transposase  27.66 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0945  ISBma2, transposase  27.66 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.867546  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1093  ISBma2, transposase  27.66 
 
 		 493 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2065  ISBma2, transposase  27.66 
 
 		 493 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1196  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 503 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780467  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1737  ISBma2, transposase  27.66 
 
 		 493 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1521  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 524 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2662  transposase  27.16 
 
 		 493 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.942406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3070  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 524 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.737169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1376  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 505 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1301  transposase  27.16 
 
 		 509 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1556  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 513 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0904  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1138  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1114  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1402  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 543 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1343  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1050  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000211286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1480  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1630  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 498 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1585  transposase  27.16 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1438  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.86843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1740  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 518 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2248  ISBma2, transposase  27.16 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>