184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3792 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3792  serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 
323 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1686  metallophosphoesterase  95.64 
 
 
321 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275545  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  80.06 
 
 
323 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  76.4 
 
 
323 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  76.4 
 
 
323 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  76.09 
 
 
323 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  75.16 
 
 
323 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  72.98 
 
 
324 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24230  hypothetical protein  70.59 
 
 
326 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000134322  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2051  hypothetical protein  70.28 
 
 
326 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00546921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34060  Metallophosphoesterase protein  67.6 
 
 
328 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  63.17 
 
 
337 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1734  serine/threonine protein phosphatase  55.31 
 
 
338 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1308  hypothetical protein  56.05 
 
 
335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1311  metallophosphoesterase  38.32 
 
 
311 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.452113  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  37.46 
 
 
309 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5182  metallophosphoesterase  37.43 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2203  metallophosphoesterase  34.94 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1103  metallophosphoesterase  34.86 
 
 
350 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0277  hypothetical protein  33.77 
 
 
323 aa  158  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0304  hypothetical protein  33 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2270  hypothetical protein  30.59 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1831  hypothetical protein  29.77 
 
 
427 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.71 
 
 
1138 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1910  hypothetical protein  27.12 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0184163  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  41.33 
 
 
850 aa  99.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  33.53 
 
 
859 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  36.77 
 
 
870 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  34.38 
 
 
858 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  36.13 
 
 
853 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  35.48 
 
 
847 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  38.36 
 
 
830 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  36.36 
 
 
852 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  36.42 
 
 
847 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  36.13 
 
 
870 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  38.85 
 
 
852 aa  79.7  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2707  metallophosphoesterase  24.64 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  39.07 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3744  putative protein serine-threonine phosphatase  33.74 
 
 
852 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614096  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  38.56 
 
 
852 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  34.38 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2179  metallophosphoesterase  33.76 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  37.5 
 
 
877 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1664  metallophosphoesterase  33.1 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0848196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  32.69 
 
 
857 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1257  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  33.77 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1099  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  33.77 
 
 
246 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1286  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  33.77 
 
 
246 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4972  metallophosphoesterase  31.66 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1362  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  33.77 
 
 
246 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4084  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  33.77 
 
 
246 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1124  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  33.77 
 
 
246 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1105  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  33.77 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1217  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  33.77 
 
 
246 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1633  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  32.89 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  32.89 
 
 
863 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  29.5 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  39.29 
 
 
847 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0778  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  29.53 
 
 
245 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1324  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  32.45 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0918  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.13 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  26.62 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  39.02 
 
 
448 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  41.18 
 
 
236 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  34.87 
 
 
834 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
269 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1112  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.79 
 
 
246 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  35.48 
 
 
864 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  37.65 
 
 
235 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  33.78 
 
 
251 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  25.99 
 
 
273 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  30.22 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
854 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  36.77 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  32.45 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  35.46 
 
 
224 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  36.11 
 
 
234 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09581  Serine/threonine specific protein phosphatase  36.71 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.392097 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43482  predicted protein  36.36 
 
 
1225 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  30.25 
 
 
227 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0573  diadenosine tetraphosphatase  28.78 
 
 
296 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  43.84 
 
 
224 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1654  serine/threonine specific protein phosphatase  32.19 
 
 
206 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0069459  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  35.37 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  30.5 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0643  diadenosine tetraphosphatase  29.08 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.5 
 
 
248 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.5 
 
 
248 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03770  Calcineurin-like phosphoesterase  35.23 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  29.5 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  39.76 
 
 
221 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04713  Ser/Thr protein phosphatase family (AFU_orthologue; AFUA_5G08620)  33.33 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
230 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
246 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  38.82 
 
 
221 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.34 
 
 
287 aa  49.3  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
250 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>