More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3714 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  100 
 
 
259 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  88.8 
 
 
259 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.57 
 
 
259 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.57 
 
 
259 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.18 
 
 
259 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  65.64 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  68.34 
 
 
258 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.95 
 
 
257 aa  347  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  69.11 
 
 
255 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  64.86 
 
 
258 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.46 
 
 
258 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.49 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.86 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.09 
 
 
258 aa  251  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.46 
 
 
252 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  47.53 
 
 
265 aa  250  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  50.37 
 
 
265 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.08 
 
 
259 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.9 
 
 
256 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  50.57 
 
 
252 aa  249  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.34 
 
 
259 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.46 
 
 
252 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.38 
 
 
259 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
280 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.19 
 
 
259 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.54 
 
 
257 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.98 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.15 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  50.98 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.58 
 
 
266 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  47.96 
 
 
266 aa  241  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.51 
 
 
264 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.42 
 
 
240 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.97 
 
 
255 aa  238  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.39 
 
 
269 aa  238  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.72 
 
 
245 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.83 
 
 
251 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.69 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  48.28 
 
 
263 aa  231  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  46.15 
 
 
252 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.69 
 
 
267 aa  228  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.36 
 
 
257 aa  228  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.21 
 
 
263 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  44.19 
 
 
257 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.19 
 
 
257 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  47.6 
 
 
284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.27 
 
 
263 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.29 
 
 
255 aa  224  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.27 
 
 
263 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.24 
 
 
251 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.7 
 
 
251 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  47.67 
 
 
250 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.21 
 
 
263 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.67 
 
 
250 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 
250 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.15 
 
 
279 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.13 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41080  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  67.08 
 
 
160 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.9 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 
266 aa  221  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.51 
 
 
250 aa  221  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.22 
 
 
295 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.66 
 
 
259 aa  222  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.37 
 
 
258 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.78 
 
 
279 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.83 
 
 
263 aa  221  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.22 
 
 
295 aa  221  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.59 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.3 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  45.22 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.53 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.54 
 
 
257 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  44.89 
 
 
267 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.14 
 
 
263 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.54 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.92 
 
 
251 aa  214  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.02 
 
 
257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  46.74 
 
 
256 aa  211  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.82 
 
 
263 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.94 
 
 
273 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
254 aa  209  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.47 
 
 
268 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.47 
 
 
268 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.47 
 
 
268 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.83 
 
 
242 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  48.47 
 
 
268 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.47 
 
 
268 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0226  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 
251 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1038  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.25 
 
 
259 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.769751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0208  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
251 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3396  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
251 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0217  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
251 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.950184  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0475  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
257 aa  206  3e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0224  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
251 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.83 
 
 
257 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 
256 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00205  predicted hydroxyacylglutathione hydrolase  44.79 
 
 
251 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3453  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.79 
 
 
251 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.837088  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.91 
 
 
263 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00210  hypothetical protein  44.79 
 
 
251 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.354314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>