24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3610 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1159    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  56.59 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  32.39 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  32.39 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  31.88 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  30.26 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  28.57 
 
 		 538 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  27.84 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6754  hypothetical protein  25.36 
 
 		 633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6273  hypothetical protein  23.91 
 
 		 633 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751843  normal  0.444824 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5715  hypothetical protein  29.6 
 
 		 324 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  24.77 
 
 		 602 aa  50.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0190  phage integrase family protein  20.38 
 
 		 698 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00182049  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  23.37 
 
 		 595 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  23.37 
 
 		 595 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  23.37 
 
 		 595 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7707  hypothetical protein  23 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26795  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7405  hypothetical protein  23 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7314  hypothetical protein  23 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3329  hypothetical protein  23 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1470  hypothetical protein  23 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0264078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0267  hypothetical protein  23 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1898  hypothetical protein  23.98 
 
 		 896 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3464  hypothetical protein  23.98 
 
 		 896 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>