More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3600 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  100 
 
 		 215 aa  446  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  97.21 
 
 		 256 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  79.53 
 
 		 255 aa  373  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  75.35 
 
 		 255 aa  362  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  75.35 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  75.81 
 
 		 255 aa  360  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  72.56 
 
 		 258 aa  345  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  72.09 
 
 		 258 aa  342  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  62.62 
 
 		 263 aa  291  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  62.15 
 
 		 263 aa  291  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  63.08 
 
 		 262 aa  290  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.28 
 
 		 263 aa  290  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  62.15 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  62.15 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  62.15 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  61.68 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  62.15 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  62.15 
 
 		 263 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  61.21 
 
 		 262 aa  289  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.28 
 
 		 263 aa  289  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  62.15 
 
 		 263 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  61.21 
 
 		 258 aa  288  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  62.15 
 
 		 263 aa  288  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.15 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.15 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  61.68 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.48 
 
 		 263 aa  287  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  59.81 
 
 		 262 aa  286  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  62.86 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  60 
 
 		 257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.48 
 
 		 262 aa  276  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  57.48 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  58.1 
 
 		 263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  57.14 
 
 		 263 aa  271  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  57.01 
 
 		 249 aa  271  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  56.54 
 
 		 263 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  57.01 
 
 		 257 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  55.35 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  55.24 
 
 		 263 aa  262  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  54.76 
 
 		 263 aa  260  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  55.56 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  53.49 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.38 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  55.14 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  54.98 
 
 		 241 aa  254  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  53.27 
 
 		 249 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  54.21 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  53.49 
 
 		 259 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.09 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  46.51 
 
 		 263 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  39.74 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.55 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.91 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.49 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.75 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  36.13 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  40.61 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  38.5 
 
 		 256 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.17 
 
 		 256 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  35.51 
 
 		 262 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.18 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.33 
 
 		 262 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.33 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.13 
 
 		 233 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  36.55 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  35.79 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  36.5 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.04 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  32.16 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  32.16 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  31.72 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.49 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.25 
 
 		 266 aa  101  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.23 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.27 
 
 		 495 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.05 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.22 
 
 		 311 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.02 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.23 
 
 		 320 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.02 
 
 		 331 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.38 
 
 		 332 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.77 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.85 
 
 		 332 aa  85.9  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.4 
 
 		 501 aa  85.5  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.04 
 
 		 331 aa  85.1  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  35.43 
 
 		 374 aa  85.1  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.71 
 
 		 331 aa  84.7  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.08 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.81 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.93 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  30.96 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.38 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  47.56 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.61 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.97 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  36.24 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  47.56 
 
 		 315 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.85 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.97 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>