68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3534 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  100 
 
 		 437 aa  892    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  89.93 
 
 		 437 aa  816    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  55.64 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  54.15 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  53.66 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  49.15 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  27.79 
 
 		 891 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.25 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  30.09 
 
 		 604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.26 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  30.43 
 
 		 803 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  28.53 
 
 		 801 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  26.14 
 
 		 614 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  22.91 
 
 		 1276 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.25 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  25.65 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  25.44 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  26.77 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  25.57 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  23.89 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  23.89 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  23.89 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  23.42 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  25.77 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  23.71 
 
 		 605 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  24.32 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  23.23 
 
 		 562 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 		 437 aa  67  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  24.42 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  23.72 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  24.56 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  24.48 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  23.46 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  24.85 
 
 		 600 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  25.99 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  22.76 
 
 		 584 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  25.52 
 
 		 662 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  23.1 
 
 		 1141 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  24.48 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  22.68 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  22.68 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  22.68 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  22.68 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  22.68 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  22.68 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  22.68 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  22.51 
 
 		 873 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  23.1 
 
 		 508 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  24.32 
 
 		 601 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  22.62 
 
 		 450 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  23.03 
 
 		 426 aa  53.5  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  22.96 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  23.45 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  24.02 
 
 		 601 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  23.19 
 
 		 596 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  24 
 
 		 564 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  24.24 
 
 		 586 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  25.71 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  23.39 
 
 		 554 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  21.83 
 
 		 460 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  22.63 
 
 		 597 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  28.68 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  21.84 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  21.67 
 
 		 1025 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1086 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3601  hypothetical protein  25.9 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3044  hypothetical protein  24.37 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  25.73 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>