More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3528 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3223  IS52, transposase  100 
 
 		 325 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3528  IS52, transposase  100 
 
 		 325 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4725  IS52, transposase  100 
 
 		 325 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  63.52 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  63.52 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  63.52 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  60.5 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  62.38 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  61.13 
 
 		 328 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  61.13 
 
 		 328 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  59.26 
 
 		 326 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  59.26 
 
 		 326 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  59.26 
 
 		 326 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  59.26 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  59.26 
 
 		 326 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  58.02 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  58.64 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  57.41 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  57.72 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  57.41 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  55.8 
 
 		 326 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 337 aa  361  9e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 337 aa  361  9e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3819  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0854  TIS1021-transposase protein  56.57 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  55.49 
 
 		 326 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1407  ISPssy transposase or derivative  61.34 
 
 		 279 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286806  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  51.08 
 
 		 326 aa  331  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  51.08 
 
 		 326 aa  331  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  51.53 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  50.77 
 
 		 326 aa  328  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  53.07 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  52.76 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01747  IS5 transposase  48.29 
 
 		 326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02453  IS5 transposase  48.29 
 
 		 326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0522589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  53.37 
 
 		 326 aa  325  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.756281 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  49.84 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  50.16 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal  1 
 
 
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