More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3521 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  57.03 
 
 		 631 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  83.39 
 
 		 642 aa  1006    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 636 aa  1277    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  98.58 
 
 		 636 aa  1263    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  89.36 
 
 		 640 aa  1047    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  84.4 
 
 		 642 aa  1041    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  54.55 
 
 		 640 aa  679    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  52.02 
 
 		 642 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  83.62 
 
 		 641 aa  998    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  57.6 
 
 		 650 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  83.7 
 
 		 642 aa  1010    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  79.19 
 
 		 639 aa  939    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2140  ABC transporter ATP-binding protein  79.84 
 
 		 640 aa  916    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25020  ABC transporter ATP-binding protein  80.47 
 
 		 640 aa  921    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  83.39 
 
 		 642 aa  1006    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  54.52 
 
 		 645 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  55.35 
 
 		 637 aa  629  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  56.24 
 
 		 632 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  51.1 
 
 		 637 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  51.1 
 
 		 637 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  51.1 
 
 		 637 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  51.4 
 
 		 641 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  51.4 
 
 		 641 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  51.4 
 
 		 641 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  51.01 
 
 		 640 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  51.25 
 
 		 641 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  50.7 
 
 		 640 aa  611  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  50.39 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  50.39 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  51.8 
 
 		 635 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  50.23 
 
 		 641 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  50.47 
 
 		 640 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  50.31 
 
 		 638 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  50.47 
 
 		 639 aa  601  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  49.45 
 
 		 632 aa  600  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  48.52 
 
 		 647 aa  598  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  52.97 
 
 		 643 aa  598  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  51.41 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 		 635 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  51.56 
 
 		 648 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  50.7 
 
 		 639 aa  594  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  50.47 
 
 		 634 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  50.85 
 
 		 649 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  50.7 
 
 		 639 aa  595  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  52.29 
 
 		 623 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  54.69 
 
 		 615 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  48.7 
 
 		 653 aa  589  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  50.54 
 
 		 642 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 633 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  50.78 
 
 		 635 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  50.78 
 
 		 635 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  50.78 
 
 		 635 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  50.78 
 
 		 635 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  50.47 
 
 		 637 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  51.81 
 
 		 641 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  50.78 
 
 		 635 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  49.23 
 
 		 635 aa  588  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  50.23 
 
 		 638 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  46.98 
 
 		 645 aa  585  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  49.46 
 
 		 645 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  50.23 
 
 		 636 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  51.99 
 
 		 631 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 646 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  50.46 
 
 		 641 aa  584  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  49.77 
 
 		 638 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  49.54 
 
 		 640 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 		 638 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  50.86 
 
 		 639 aa  579  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  52.13 
 
 		 627 aa  580  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  49.69 
 
 		 635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  48.99 
 
 		 641 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  48.59 
 
 		 642 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  48.67 
 
 		 639 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  49.23 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  49.23 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  49.23 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  49.23 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  49.23 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  49.23 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  49.23 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  49.37 
 
 		 636 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  47.69 
 
 		 648 aa  567  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  49.67 
 
 		 663 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 637 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  50.7 
 
 		 628 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  47.23 
 
 		 648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  48.58 
 
 		 634 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  48.91 
 
 		 640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  52.44 
 
 		 639 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  51.88 
 
 		 623 aa  559  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1686  ABC transporter related  49.3 
 
 		 625 aa  555  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.750234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  50.16 
 
 		 636 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  48.52 
 
 		 641 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  47.39 
 
 		 648 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  50.55 
 
 		 626 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  49.46 
 
 		 644 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  48.43 
 
 		 629 aa  548  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3061  ABC transporter related  50.54 
 
 		 663 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0828579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  48.17 
 
 		 649 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  48.17 
 
 		 661 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>