219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3470 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  89.74 
 
 
311 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  75.84 
 
 
358 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  76.43 
 
 
316 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  77.81 
 
 
316 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  74.83 
 
 
314 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  78.2 
 
 
316 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  70.83 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  66.23 
 
 
307 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  60.64 
 
 
300 aa  332  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.99 
 
 
297 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  56.03 
 
 
308 aa  279  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  42.76 
 
 
299 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 
301 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
293 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  33.56 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  34.51 
 
 
298 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  32.18 
 
 
301 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 
312 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 
308 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  33.1 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  32.87 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  32.87 
 
 
303 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  32.87 
 
 
303 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  32.87 
 
 
303 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  32.87 
 
 
303 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  32.18 
 
 
301 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  32.18 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  32.18 
 
 
303 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  31.83 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  31.94 
 
 
294 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  28.81 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  32.49 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  33.22 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
301 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  27.53 
 
 
288 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  29.54 
 
 
306 aa  106  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  32.38 
 
 
296 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  28.57 
 
 
301 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 
315 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  28.9 
 
 
305 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.99 
 
 
292 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  28.22 
 
 
294 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  30.85 
 
 
297 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 
312 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  30.95 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  27.53 
 
 
288 aa  99.4  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  29.72 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  31.87 
 
 
311 aa  99  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  27.72 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  28.11 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.46 
 
 
302 aa  96.3  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 
300 aa  95.5  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  34.6 
 
 
317 aa  95.5  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  27.82 
 
 
295 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  28.52 
 
 
302 aa  94  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.23 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.11 
 
 
313 aa  92.8  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  29.33 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
294 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  29.45 
 
 
310 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
313 aa  89  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  26.8 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  26.09 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.78 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  31.29 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.22 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  24.03 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  29.97 
 
 
298 aa  85.9  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  26.21 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  31.79 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  27.33 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  27.56 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  27.56 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  31.15 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.97 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  29.23 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  33.69 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.18 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.15 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.41 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  29.58 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  31.29 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  27.31 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 
290 aa  79  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  29.76 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>