66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3468 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  933  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  87.58 
 
 
467 aa  824  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  73.14 
 
 
471 aa  672  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  34.12 
 
 
474 aa  244  2e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  34.97 
 
 
465 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 
455 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  36.36 
 
 
466 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  35.94 
 
 
466 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.82 
 
 
481 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  35.94 
 
 
466 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  35.94 
 
 
466 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  35.94 
 
 
466 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  35.94 
 
 
466 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  35.73 
 
 
466 aa  223  5e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  36.23 
 
 
470 aa  223  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  32.82 
 
 
469 aa  217  3e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  32.6 
 
 
469 aa  215  1e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.75 
 
 
475 aa  213  4e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  32.83 
 
 
474 aa  212  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.3 
 
 
468 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  31.81 
 
 
442 aa  206  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  34.48 
 
 
473 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  33.41 
 
 
454 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  34.65 
 
 
460 aa  205  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.34 
 
 
460 aa  203  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.34 
 
 
460 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  34.82 
 
 
462 aa  200  4e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  33.55 
 
 
455 aa  200  4e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  34.32 
 
 
473 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  32.63 
 
 
471 aa  189  6e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  32.91 
 
 
444 aa  190  6e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.87 
 
 
443 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  32.03 
 
 
456 aa  185  2e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  30.52 
 
 
445 aa  183  5e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.26 
 
 
453 aa  183  5e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
485 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.87 
 
 
482 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  31.83 
 
 
464 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  35.15 
 
 
1751 aa  176  1e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
523 aa  175  1e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  29.93 
 
 
453 aa  176  1e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
445 aa  174  3e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  32.7 
 
 
470 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  29.53 
 
 
479 aa  166  6e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
478 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  30.89 
 
 
478 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.75 
 
 
455 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
480 aa  159  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  28.82 
 
 
499 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.53 
 
 
883 aa  142  1e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  28.33 
 
 
466 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  25.74 
 
 
468 aa  115  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.42 
 
 
506 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  25.64 
 
 
458 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  25.7 
 
 
468 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  27.52 
 
 
633 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  24.95 
 
 
490 aa  80.1  7e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 
479 aa  63.9  5e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  30.88 
 
 
477 aa  61.2  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  27.35 
 
 
507 aa  60.8  5e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  19.06 
 
 
500 aa  53.1  1e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  19.06 
 
 
500 aa  53.1  1e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  30.11 
 
 
644 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  31.82 
 
 
125 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  37.93 
 
 
239 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.42 
 
 
608 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>