More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3447 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
369 aa  755    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  83.56 
 
 
371 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.51 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 
351 aa  213  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 
390 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 
364 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  35.63 
 
 
359 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  34.75 
 
 
346 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
346 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
361 aa  195  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 
358 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
358 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 
414 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 
361 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  35.46 
 
 
361 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  35.39 
 
 
359 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
359 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  35.39 
 
 
359 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 
414 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 
414 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 
414 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 
401 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 
394 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
371 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 
340 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
366 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  31.05 
 
 
419 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
394 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
354 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
354 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
672 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
343 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
365 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
376 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 
370 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
382 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
381 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  34.23 
 
 
351 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
400 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3768  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
366 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
385 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
371 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
397 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
375 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
366 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.41 
 
 
373 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
369 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
364 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
381 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
355 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 
376 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
361 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
374 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  30.77 
 
 
336 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  30.85 
 
 
353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.92 
 
 
364 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
349 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  27.45 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
374 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  27.45 
 
 
372 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  31.34 
 
 
381 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
370 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
374 aa  126  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  30.71 
 
 
430 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
366 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
1089 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
378 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
386 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  29.46 
 
 
375 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  29.46 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
420 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
431 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>